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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002525`

染色体: Chr06 坐标: 36240608-36242132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002525`
名称	SmilChr06G002525
描述	uncharacterized SmilChr06G002525
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36240608 - 36242132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990840`
GeneID	`130990840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990840`
原始查询	`LOC130990840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.5; qcov=1.13; evalue=1.92e-33; confidence=weak
Rice	`Os01g0595300` - identity=25.6; qcov=1.11; evalue=1.04e-38; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771055.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771055.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771055.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771055.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36240619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr6:36240637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr6:36240680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr6:36240694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B83,C72
`Chr6:36240700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C45,D9
`Chr6:36240712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B83,C72
`Chr6:36240749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B83,C72
`Chr6:36240762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr6:36240766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D3
`Chr6:36240772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B83,C72
`Chr6:36240811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C52,D9
`Chr6:36240851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771055.1

338 aa

169

338

MULE

SWIM

PF10551 MULE 65-140 aa PF04434 SWIM 264-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771055.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	65	140	5.3e-13	49.9	MULE transposase domain
`XP_057771055.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	264	295	4.8e-07	29.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915072.1
ATGGCGGTGGAGATGATATACTGCGGACACGAAGAATCTTATGGATTGCTACCATGCTATCTTCACATGTTGCGGATGTGCAATCCGGGATCGGTGACTGACTTGGAAGTTGATGAGAATGATCGGTTGAAGCATCTCTTCGTAGCACTTGGTTCTTACAGAGTCGCGTACACTATGTGCATGAGGCCAATAATTATTGTTGACGGCACACACTTGAAGGGCCGCAATAAAGGTGTTTTGTTCGTTGCCGTCACAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990840
ATGGCGGTGGAGATGATATACTGCGGACACGAAGAATCTTATGGATTGCTACCATGCTATCTTCACATGTTGCGGATGTGCAATCCGGGATCGGTGACTGACTTGGAAGTTGATGAGAATGATCGGTTGAAGCATCTCTTCGTAGCACTTGGTTCTTACAGAGTCGCGTACACTATGTGCATGAGGCCAATAATTATTGTTGACGGCACACACTTGAAGGGCCGCAATAAAGGTGTTTTGTTCGTTGCCGTCACAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771055.1
MAVEMIYCGHEESYGLLPCYLHMLRMCNPGSVTDLEVDENDRLKHLFVALGSYRVAYTMCMRPIIIVDGTHLKGRNKGVLFVAVTKDDNEQVFPMAFGIGPIENDESWKWFFYRLKVAYGQNSETLIVSDAHISIQNAVKYGKAVVAFYQKAAYAYRESDFDKAMASLKALNEDGGAYTKLMQVGPERWALSVLRLPICSMVEAIRHIIEKWFDERQEAAKTFSADVTPEALRKLTTELERSRRYEVVAMSPSAFKVKDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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