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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002534`

染色体: Chr06 坐标: 36378911-36380193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002534`
名称	SmilChr06G002534
描述	uncharacterized SmilChr06G002534
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36378911 - 36380193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990842`
GeneID	`130990842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990842`
原始查询	`LOC130990842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.9; qcov=0.98; evalue=4.17e-11; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=28.6; qcov=0.971; evalue=2.36e-18; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771058.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771058.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771058.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771058.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36378914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C83
`Chr6:36378921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B131,B132,C39,C82
`Chr6:36378925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:36378929`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,A2,B66,B85,C55
`Chr6:36378929`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A11,A2,B66,B85,C55
`Chr6:36378939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,C57,C6,D3
`Chr6:36378942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:36378991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A2,B86,D8
`Chr6:36378991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B86,D8
`Chr6:36379012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,C30,C47,C8
`Chr6:36379020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B18,C20,C36
`Chr6:36379026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B53,C32,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771058.1

205 aa

102

205

SWIM

PF04434 SWIM 66-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771058.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	66	95	9.9e-06	25.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915075.1
GTTTGTTGCTCTTGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTACTTTCACCTTCGACCAGTGATTGTGGTTGACGGCACACACCTGAAGGGAAAAAAATAGTGGCATTTTGTTTGTCGCCGTGATAAAAGACGGAAACGAGGCAGTTTTTCCCTTGGCGATCGGTGTCGGTCCGATCGAGAATGATGAGTCGTGGAAGTGGTTTATGTCACATCTGAGAGGTGCTTGCGGCGAGCCCGATAACTTACTTATTGTATCTGATGCGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990842
ATGTTGGAGGCAGTCAGATTAGTTATCGAGCAGTGGTTCAACGACAGGCTTGCGGCCGCACAAGAGAGCGATGAAAATCTGACTCCGGAGGCAAAACAGAAGCTCAGTGCAGAACTTGTAAAAAGTCGTCGTTACACAGCCAAGAGGACCACCGAGAGAAAATACAGGGTTCGTGCTAGTGGTCGCCATTATATGGTTGACCTTCAAAAGCAGAGCTGTGAATGCAACGAATTCAACCTGGACCAGATGCCGTGTTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771058.1
MLEAVRLVIEQWFNDRLAAAQESDENLTPEAKQKLSAELVKSRRYTAKRTTERKYRVRASGRHYMVDLQKQSCECNEFNLDQMPCSHAIAAITEANESVEDYVHSYYWNSSLVDTYSRAVNHLPPIENWNIPFQIASQLVLPNLSRRQAGRPKETRVRSAGERPTQNTSTAEASTSSKKRAPKTCGLCGGSGHTRRSCKGTATDA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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