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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002587`

染色体: Chr06 坐标: 37075459-37076366 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002587`
名称	SmilChr06G002587
描述	uncharacterized SmilChr06G002587
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37075459 - 37076366 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990858`
GeneID	`130990858`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990858`
原始查询	`LOC130990858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G42860` (AT3G42860) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823332] identity=36.5; qcov=0.465; evalue=8.08e-06; confidence=low
Rice	`Os11g0256300` - identity=37.3; qcov=0.421; evalue=1.16e-10; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990858

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771070.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057771070.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057771070.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057771070.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37075507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr6:37075636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:37075654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:37075801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr6:37075804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:37075995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771070.1

159 aa

159

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 40-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771070.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	40	75	1.7e-09	38.3	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915087.1
TGGCAAGGGGGGTATCAAATACCCCCCTATCTTAATTAATTTTGAACAAATAAACCCTTTGATCTAACGTCCACTTAACAGACGTTTTCTTATTATTTTTTTTTATTTTTCTTTTTTTTGGTGGGTCCCACTTGTAACTACCCGAAATCCCCCTTTTTATTTGGGGAATATGTTTGCGTTCGAAGAACCCTAGCCGGCGATGATTTGTTGCAAATTCCCGATCATCTTTCGGGTTTTCCTGAAATTAGAATAGGGTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990858
ATGAGTCTAAATTCCGCCTCTGGTGGTTATGGATCGAGCACATCGCGCGGTGGACGTCAGTTTGAAGATAATCAAAATCCCAGGCGTTGTACGTGCGAAATTGACGGTAGAAGGTTGAGGGCTGTGATAATGACATCGTGGACTGACGAAAACCCCGGTAGGAGGTTTTATGGATGTCGAAATTGGAAGACGAAGAACTGCGGTTTTTTTGATTGGCTTGACGAACCAATTAGCGAAAGAGGCAAGGAAGTTATCAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771070.1
MSLNSASGGYGSSTSRGGRQFEDNQNPRRCTCEIDGRRLRAVIMTSWTDENPGRRFYGCRNWKTKNCGFFDWLDEPISERGKEVINELKLMKIKDSSSSAPTDMEPKIVKLWDFVQALKSESSEIKKKVRLVTAMLLASWIMYPFVLEMKLKHILDYMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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