当前解析结果
SmilChr06G002588| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002588 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002588 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002588 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 37082597 - 37086628 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990859 |
|---|---|
| GeneID | 130990859 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990859 |
| 原始查询 | LOC130990859 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=32.9; qcov=0.794; evalue=6.12e-30; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990859 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771071.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057771071.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771071.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771071.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057771071.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:37082605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr6:37082679 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B13,B15,C1,C87 |
Chr6:37082944 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 43 | A11,A13,A18,A22,A7,A8,A9,B10,B104,B108,B109,B111,B112,B115,B117,B121,B122,B129,B132,B137,B18,B20,B21,B31,B5,B54,B59,B6,B77,B85,B88,B9,B90,B92,B93,C1,C34,C50,C51,C58,C67,C84,C9 |
Chr6:37083015 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr6:37083043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr6:37083102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr6:37083167 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B36 |
Chr6:37083167 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr6:37083185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr6:37083357 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr6:37086454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B104 |
Chr6:37086454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。