当前解析结果
SmilChr06G002618| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002618 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002618 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002618 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 37649103 - 37649960 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990870 |
|---|---|
| GeneID | 130990870 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990870 |
| 原始查询 | LOC130990870 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=30.2; qcov=0.93; evalue=5.46e-29; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990870 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771082.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057771082.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057771082.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057771082.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771082.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:37649103 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B13,B32,B36,C40 |
Chr6:37649114 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B105,C34,C87,D5 |
Chr6:37649115 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B110,B19,B30,B4,B47,B48,B54,B67,B71,C32,D1 |
Chr6:37649121 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B80,C4,D11 |
Chr6:37649124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,D5 |
Chr6:37649139 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,D10 |
Chr6:37649146 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,C54,C65,C84 |
Chr6:37649162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B1,B10,B83,C77,D5 |
Chr6:37649162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B10,B83,C77,D5 |
Chr6:37649172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B57 |
Chr6:37649187 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A1,A10,A11,A13,A6,B113,B136,B22,B3,B45,B56,B97,C13,C3,C44,C63,C64,C66,D7 |
Chr6:37649190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,B97 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。