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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002623`

染色体: Chr06 坐标: 37762244-37763023 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002623`
名称	SmilChr06G002623
描述	uncharacterized SmilChr06G002623
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37762244 - 37763023 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990874`
GeneID	`130990874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990874`
原始查询	`LOC130990874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378]; symbol=AT1G70420; hit=AT1G70420; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378]; symbol=AT1G70420; hit=AT1G70420; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G70420` (AT1G70420) DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378] identity=36.8; qcov=0.892; evalue=1.97e-36; confidence=medium
Rice	`Os05g0568600` - identity=34.6; qcov=0.927; evalue=3.61e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07816 (DUF1645)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771084.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771084.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771084.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771084.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37762458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B69,B9,D7
`Chr6:37762471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:37762480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:37762514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A10,A18,A5,B1,B102,B103,B111,B118,B119,B125,B131,B139,B18,B29,B35,B37,B39,B41,B43,B44,B49,B53,B58,B65,B69,B7,B70,B78,B81,B82,B85,B87,B90,B92,B94,C13,C15,C24,C29,C30,C31,C34,C39,C45,C47,C62,C64,C7,C71,C75,D2,D5
`Chr6:37762519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B78,C23
`Chr6:37762538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:37762553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr6:37762558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:37762574`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A18,A2,A25,A5,B1,B103,B117,B118,B119,B120,B139,B18,B29,B35,B37,B41,B42,B45,B53,B64,B65,B69,B7,B70,B75,B78,B82,B87,B90,B92,C1,C13,C15,C16,C27,C30,C31,C33,C34,C38,C39,C45,C52,C54,C64,C7,C75,C76,C87,D2,D5
`Chr6:37762575`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A18,A2,A25,A5,B1,B103,B117,B118,B119,B120,B139,B18,B29,B35,B37,B41,B42,B45,B53,B64,B65,B69,B7,B70,B75,B78,B82,B87,B90,B92,C1,C13,C15,C16,C27,C30,C31,C33,C34,C38,C39,C45,C52,C54,C64,C7,C75,C76,C87,D2,D5
`Chr6:37762593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B69,B74
`Chr6:37762600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B22,B69,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771084.1

259 aa

130

259

DUF1645

PF07816 DUF1645 61-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771084.1`	Pfam	`PF07816`	DUF1645	Family	61	237	3.3e-28	100.3	Protein of unknown function (DUF1645)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915101.1
ATGGATAACAGGCTAAACAGCAGAGAAGATGCATATACCAGCCCTAGCTTCAACAGCTATTCATCCGATAGATTAGCCGAACTCGCCGTGCAAATCTCCGCGGAGAAGAGCGGAGACGACAACGAAGAAAACGAAGATTTCGAATTCTCTCTGGTGCGCGAGGATTTCAAGGAGTTTTCAGCCGAGGATTTCGTCTACGACGGCAAGCTCGGCCCGATCTTTCCGGTGTTCAACCGCGATCTCCTGCTGCGCGACGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990874
ATGGATAACAGGCTAAACAGCAGAGAAGATGCATATACCAGCCCTAGCTTCAACAGCTATTCATCCGATAGATTAGCCGAACTCGCCGTGCAAATCTCCGCGGAGAAGAGCGGAGACGACAACGAAGAAAACGAAGATTTCGAATTCTCTCTGGTGCGCGAGGATTTCAAGGAGTTTTCAGCCGAGGATTTCGTCTACGACGGCAAGCTCGGCCCGATCTTTCCGGTGTTCAACCGCGATCTCCTGCTGCGCGACGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771084.1
MDNRLNSREDAYTSPSFNSYSSDRLAELAVQISAEKSGDDNEENEDFEFSLVREDFKEFSAEDFVYDGKLGPIFPVFNRDLLLRDGGGDDQCESSIQVPLSQLLLEDRGSGNDNPPSCSSSEADELESVPAGTYCVWRPKASDLRSPSRCKKSKSTGSASKRWKFRDLMRRSNSDGKDSLVFLTPKNREEKLPAEIPKKLKGKGGSSSGAAARSAHEALYVRNRAMNEVDRKKSYLPYRQDLVGFFINVNALGKGLPHF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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