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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002719`

染色体: Chr06 坐标: 39260579-39263121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002719`
名称	SmilChr06G002719
描述	uncharacterized SmilChr06G002719
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39260579 - 39263121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990898`
GeneID	`130990898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990898`
原始查询	`LOC130990898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0182900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0182900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0182900` - identity=32.9; qcov=0.337; evalue=5.45e-06; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12796 (Ank_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057771109.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771109.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771109.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771109.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39260585`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	74	A1,A13,A18,A19,A21,A22,A4,A5,A7,B1,B105,B114,B117,B119,B120,B121,B123,B124,B127,B128,B13,B130,B139,B14,B140,B18,B20,B23,B25,B27,B33,B34,B4,B41,B44,B49,B5,B52,B55,B57,B62,B67,B71,B72,B78,B79,B8,B82,B85,B86,B9,B90,B92,B98,C10,C11,C14,C17,C20,C35,C38,C39,C4,C55,C57,C60,C63,C65,C69,C70,C75,C87,D10,D11
`Chr6:39260592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B15,B63,B77,C21
`Chr6:39262107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D11
`Chr6:39262121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B7,C30
`Chr6:39262130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B7,C23,C30
`Chr6:39262190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B41,C26
`Chr6:39262196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B38,B65,D1
`Chr6:39262216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr6:39262236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B10,C80
`Chr6:39262251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A25,B27,C62
`Chr6:39262300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B23,B60,C30,C71
`Chr6:39262311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771109.1

208 aa

104

208

Ank_2

PF12796 Ank_2 7-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771109.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	7	74	3.4e-07	31.5	Ankyrin repeats (3 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915126.1
ATGTGGCGACAAGCAGCCATCGTTGAAGAGGTTCTGAAGATCAATCCACGGCTTGCTACGAGTTTGGACTCGAGAAATTCGTCGCCTCTTCACATCGCAGCTGCGGAGGGGAGCCTCGAGATAGTGAAGAATTGTTTTGGTGGACAGTTTGATGAATTTCTGGATGCAAAGGATGATGATGGGGAGACAATATTGCATTTGGCTGCTAGGTCCAATCAACCAAAAGAGAGGCGGTACAAAACGTTCAAGGAGCTTACACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990898
ATGTGGCGACAAGCAGCCATCGTTGAAGAGGTTCTGAAGATCAATCCACGGCTTGCTACGAGTTTGGACTCGAGAAATTCGTCGCCTCTTCACATCGCAGCTGCGGAGGGGAGCCTCGAGATAGTGAAGAATTGTTTTGGTGGACAGTTTGATGAATTTCTGGATGCAAAGGATGATGATGGGGAGACAATATTGCATTTGGCTGCTAGGTCCAATCAACCAAAAGAGAGGCGGTACAAAACGTTCAAGGAGCTTACACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771109.1
MWRQAAIVEEVLKINPRLATSLDSRNSSPLHIAAAEGSLEIVKNCFGGQFDEFLDAKDDDGETILHLAARSNQPKERRYKTFKELTRMKEMHRDLQTNELVASEEVWETIFKGNVFAKAYLREGEPHYYVMCLLFGKHDIRQENSRTVILISDSPNPTINNTLHIISSSPDDDVSSYVIPTPPKSARKLFIDDAMSCVGALCWISSLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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