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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002783`

染色体: Chr06 坐标: 40505069-40505773 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002783`
名称	SmilChr06G002783
描述	uncharacterized SmilChr06G002783
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40505069 - 40505773 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990912`
GeneID	`130990912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990912`
原始查询	`LOC130990912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=31.1; qcov=0.595; evalue=2.28e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771122.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057771122.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057771122.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771122.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40505111`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	86	A10,A16,A18,A19,A23,A6,B10,B104,B108,B111,B112,B114,B119,B122,B126,B130,B136,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B22,B26,B3,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B45,B47,B53,B58,B59,B64,B67,B7,B70,B72,B74,B75,B8,B80,B81,B82,B85,B89,B91,B93,B95,B97,B98,C10,C15,C16,C24,C25,C27,C28,C29,C32,C34,C39,C41,C42,C44,C48,C56,C6,C62,C68,C7,C73,C79,C83,C86,D10,D11,D6,D7
`Chr6:40505158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A14,B23,B58,C36,C5,C82
`Chr6:40505159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:40505183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B44
`Chr6:40505215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A21,B2,B28,B82,C87,D4,D5
`Chr6:40505319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B61,B83,C63
`Chr6:40505371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr6:40505400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr6:40505415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr6:40505501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B125,B4,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771122.1

173 aa

173

DUF223

PF02721 DUF223 13-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771122.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	13	130	6.6e-19	69.0	Domain of unknown function DUF223

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915139.1
ATGTCGCCGAATAATGAAGCTATTCCTTTGAATGCCATCAAGGAAAAAATACGAAATAAATATGTGATTGTCAGAATTTTGCGCTTATGGGTTCAAAAAGATAAATTGGGCAAGGAAGCACTTGAAATGATCGTGATTGATGAATGGGGCAACAAAATCCAAGCATCCGTCTCAATAGGGTACAAGAACAAGTTTCATGAGTTGCTTAAAGAGGGACAAATAACAGTTATTAAAAACTTCCAAGTAGTGCAAAACAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990912
ATGTCGCCGAATAATGAAGCTATTCCTTTGAATGCCATCAAGGAAAAAATACGAAATAAATATGTGATTGTCAGAATTTTGCGCTTATGGGTTCAAAAAGATAAATTGGGCAAGGAAGCACTTGAAATGATCGTGATTGATGAATGGGGCAACAAAATCCAAGCATCCGTCTCAATAGGGTACAAGAACAAGTTTCATGAGTTGCTTAAAGAGGGACAAATAACAGTTATTAAAAACTTCCAAGTAGTGCAAAACAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771122.1
MSPNNEAIPLNAIKEKIRNKYVIVRILRLWVQKDKLGKEALEMIVIDEWGNKIQASVSIGYKNKFHELLKEGQITVIKNFQVVQNNHNFQHAKINHEWKISFSLRTIVSESTERLNITENGFDFIHFRNIHSHDSELVLDILGEVKTENITIDCVEMKHGKAKKCDITLADAE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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