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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002800`

染色体: Chr06 坐标: 40702878-40706075 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002800`
名称	SmilChr06G002800
描述	amino acid transporter AVT1J-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40702878 - 40706075 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990920`
GeneID	`130990920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990920`
原始查询	`LOC130990920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT1J-like
产物	amino acid transporter AVT1J-like
Arabidopsis	`AT5G15240` (AT5G15240) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831376] identity=45.8; qcov=0.648; evalue=6.47e-53; confidence=high
Rice	`Os04g0460300` (OsATL13) - identity=41.5; qcov=0.552; evalue=3.86e-37; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04082 (Neuroactive ligand signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057771130.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771130.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771130.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771130.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40702904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:40702909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B90,B92,C61
`Chr6:40702910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B50,C7
`Chr6:40702911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:40702934`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A22,A24,A25,A3,A6,A8,B1,B111,B114,B115,B117,B120,B122,B125,B127,B13,B132,B134,B16,B29,B31,B37,B39,B41,B43,B44,B45,B53,B55,B61,B64,B66,B7,B72,B75,B76,B77,B78,C1,C11,C12,C16,C2,C23,C28,C3,C37,C39,C40,C42,C46,C47,C48,C50,C53,C54,C57,C6,C60,C63,C64,C66,C67,C69,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C81,C87,D4,D9
`Chr6:40702942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B122,B80
`Chr6:40702943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C37,C77
`Chr6:40702965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B80
`Chr6:40702979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B122,B80
`Chr6:40702980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr6:40702986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:40702993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B122,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771130.1

310 aa

155

310

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 1-108 aa PF01490 Aa_trans 121-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771130.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	1	108	5.1e-32	111.8	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057771130.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	121	282	5.1e-32	111.8	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915147.1
ATGGCGATTTTAGGTTACAAAATGTTCGGATCGGAGCTGCAATCTCAGATCACGTTGAACCTTCCGATGAATAAATTGAGCTCAAAAGTGGCTATCTTCACCGCTCTGCTCAATCCCATTGCCAAATACGCACTGATGCTGAAGCACATCGTTGATGCAGTTGAGAGAGGCGGTGTCTGGCGGCGGTCGTTGGCACGAGTCGCGTTGATCGGCGGCAGCGTGTTCGTGGCCCTAACGGTGCCGTTTTTCGGATACCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990920
ATGGCGATTTTAGGTTACAAAATGTTCGGATCGGAGCTGCAATCTCAGATCACGTTGAACCTTCCGATGAATAAATTGAGCTCAAAAGTGGCTATCTTCACCGCTCTGCTCAATCCCATTGCCAAATACGCACTGATGCTGAAGCACATCGTTGATGCAGTTGAGAGAGGCGGTGTCTGGCGGCGGTCGTTGGCACGAGTCGCGTTGATCGGCGGCAGCGTGTTCGTGGCCCTAACGGTGCCGTTTTTCGGATACCTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771130.1
MAILGYKMFGSELQSQITLNLPMNKLSSKVAIFTALLNPIAKYALMLKHIVDAVERGGVWRRSLARVALIGGSVFVALTVPFFGYLMSIVGAFLSVTASILLPCFLILVADNMNNLLPNLQVLVLCFVITTAVCASIAILGYLMFGSELQSQITLNLPTDKLASKVATYTILVNPLAKYALFLKPLIDAIEIRLLSKHGNRIYSLCTRSVLLCSTVLVAITIPHYDIFMSLIGAFTTVIGLILLPCFCYLRISGAYRDLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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