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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002815`

染色体: Chr06 坐标: 40862184-40866430 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002815`
名称	SmilChr06G002815
描述	uncharacterized SmilChr06G002815
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40862184 - 40866430 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990924`
GeneID	`130990924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990924`
原始查询	`LOC130990924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=29.8; qcov=0.87; evalue=1.09e-24; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=23.3; qcov=0.922; evalue=1.93e-13; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771132.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771132.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771132.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771132.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40862231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B140
`Chr6:40862232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B103,B119,B124,B26,B84,C69
`Chr6:40862256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C37
`Chr6:40862283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr6:40862289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,C21,C32,C37,C68
`Chr6:40862312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B25,C27,C31,C65
`Chr6:40862323`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A2,A22,A8,B11,B12,B136,B140,B18,B50,B57,B61,B90,B92,C37,C39,C46,C47,C48,C57,C58,C6,C61,C7,C73,C77,D10,D11,D4,D9
`Chr6:40862349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr6:40862351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	B103,B105,B119,B120,B124,B134,B21,B26,B36,B74,B84,B93,C10,C11,C28,C39,C40,C69,C86,D10
`Chr6:40862384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B67,C21,C63
`Chr6:40862389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:40862399`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771132.1

293 aa

146

293

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 37-107 aa PF13456 RVT_3 218-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771132.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	37	107	1.1e-13	52.4	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057771132.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	218	284	7.2e-08	33.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915149.1
ATGACCGGCGGCGGCGGCGGACAGCTGGAGGCGGCGCCGGATGGTGGGCAGAAGAGGTACTTACTTGCTTGCTCTTTACGGCAACGCAACGAGGCTTCTTCCTCTCGGTTGGTGAATCCACTGTGGAATTGGATTTGGGGTCTTGAGGTAGTCCCAAAGGTTAAGCTTTTTTTGTGGAAATGTCTCTCGGGAGCTCTCCCATCATCCCAAACTCTGGTGGTACGTTCTATTGACATTGATCCGATTTGTCGTAGATGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990924
ATGACCGGCGGCGGCGGCGGACAGCTGGAGGCGGCGCCGGATGGTGGGCAGAAGAGGTACTTACTTGCTTGCTCTTTACGGCAACGCAACGAGGCTTCTTCCTCTCGGTTGGTGAATCCACTGTGGAATTGGATTTGGGGTCTTGAGGTAGTCCCAAAGGTTAAGCTTTTTTTGTGGAAATGTCTCTCGGGAGCTCTCCCATCATCCCAAACTCTGGTGGTACGTTCTATTGACATTGATCCGATTTGTCGTAGATGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771132.1
MTGGGGGQLEAAPDGGQKRYLLACSLRQRNEASSSRLVNPLWNWIWGLEVVPKVKLFLWKCLSGALPSSQTLVVRSIDIDPICRRCGAFEETVEHALRDCPWVSFFWESLVLRIQPLPPDGLISLEDWFERIRQNPQKEVHQSFASLLWSLWYARNLLVFQGKVLSHEECVGVAQRAIWTRRVCLGWAAAKPVTLLCNQVLQLKISCDAALDGVAGMGFGVAISNGDGEMEGCRYGYRQGVFSALEGEAIAVLEGLLLCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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