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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003214`

染色体: Chr01 坐标: 50926238-50937820 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003214`
名称	SmilChr01G003214
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50926238 - 50937820 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990941`
GeneID	`130990941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990941`
原始查询	`LOC130990941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
Arabidopsis	`AT2G37900` (AT2G37900) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818366] identity=25.5; qcov=1.02; evalue=4.5e-31; confidence=low
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=26.2; qcov=1.04; evalue=1.33e-26; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771148.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771148.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057771148.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771148.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50926383`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	110	A1,A10,A14,A15,A20,A23,A24,A25,A5,A9,B10,B102,B108,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B122,B123,B126,B127,B128,B131,B133,B14,B140,B19,B20,B26,B27,B28,B3,B30,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B44,B45,B49,B52,B53,B54,B57,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B70,B74,B78,B80,B83,B84,B85,B89,C1,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C36,C38,C43,C45,C49,C50,C52,C54,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C71,C72,C75,C82,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr1:50926384`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A1,A13,A16,A18,A21,A22,A25,A4,A5,B100,B101,B104,B105,B106,B11,B110,B115,B118,B13,B138,B15,B16,B19,B20,B21,B34,B4,B46,B49,B5,B51,B59,B6,B60,B61,B66,B68,B69,B77,B82,B87,B95,B97,B98,C1,C10,C22,C25,C30,C32,C37,C38,C40,C42,C44,C46,C48,C5,C50,C51,C53,C54,C60,C67,C68,C70,C71,C76,C78,C82,D3
`Chr1:50926391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C50,C61,D4,D5
`Chr1:50926456`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	B128,B132,B15,B17,B31,B32,B47,B63,B9,C14,C34,C37,C47,C74,C79,D1,D3
`Chr1:50926612`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A11,A15,A24,B10,B109,B113,B114,B119,B122,B127,B131,B140,B26,B29,B37,B4,B55,B65,B67,B82,B85,C16,C2,C20,C26,C30,C31,C36,C58,C85,C87,D11,D6
`Chr1:50926760`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,A3,B107
`Chr1:50926760`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A20,A3,B107
`Chr1:50926787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B76,C23
`Chr1:50926797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B76,C23
`Chr1:50926834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:50926912`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,B101,B117,B123,B14,B80,C57,C59,C63,D8
`Chr1:50926914`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A14,B101,B117,B123,B14,B80,C57,C59,C63,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771148.1

506 aa

253

506

PTR2

PF00854 PTR2 203-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771148.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	203	439	3.6e-10	40.0	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915165.1
TTTTGAACACGAGTTTTAGAAAAACTTAATCGTGTGTTTCTGGTGAATGGAGAAGGTGCCCCACAATTTATAAAAAGGGGTGATAGTTAATAGATTTATATAGACTCATTAGCGGTAGTATGTGTAAATATGTAGAAATTTCAAGGATGATTAGTTAATGGGGTTATGTCCAAAAAATGAGTAGGAATATTTTATGGAGAGAGGGAGTAATATATATGGCTGACTTGAGAGGAAGATGAGTGATCAAATATGCGTATGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990941
ATGAAGCCCATCCAAGTTCTACACTGGTGTCGGGAGACGTTTCATTACTACGTCGTTTTCACGAACTCCATCTTGTTCATCTTAGGCCTCATATTCAGCTACAAGTTGGTGGAGAAGACATTTCTGAACATTTTGATAACGCGTCTCACCGACGCGTGGGAGGAGTACGACCTCCGAAGAGCTGTAGTGGTCGTGAATTTGATGGAAGGAACAATCGCAATTCTCGTTGCGTTGTTCGCTTATGTAGCTAACATTTATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771148.1
MKPIQVLHWCRETFHYYVVFTNSILFILGLIFSYKLVEKTFLNILITRLTDAWEEYDLRRAVVVVNLMEGTIAILVALFAYVANIYTGRFQMVVISTAFCITGLLLNSLADGNDDNRQLELRLFYPALGLMALALASQIASLQPFLEDQLRPMVVDGDRRQGCTKFWWNLVSFVAAIFAQFGPLPRFHFKKLAIVLIGVMSGCVLVFMLGTKYYYMVSTIPNPFKEVGIVIVRAIANRNLDYTQTPEPRVLCLRWLDKGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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