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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001995`

染色体: Chr06 坐标: 25366012-25380263 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001995`
名称	SmilChr06G001995
描述	probable cadmium/zinc-transporting ATPase HMA1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	25366012 - 25380263 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990945`
GeneID	`130990945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990945`
原始查询	`LOC130990945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cadmium/zinc-transporting ATPase HMA1, chloroplastic
产物	probable cadmium/zinc-transporting ATPase HMA1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G37270` (HMA1) heavy metal atpase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829881] identity=71.6; qcov=0.881; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0690700` (OsHMA1) - identity=70.9; qcov=0.856; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0019829 (ATPase-coupled monoatomic cation transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00122 (E1-E2_ATPase); PF00702 (Hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771147.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057771147.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771147.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771147.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:25366233`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr6:25366233`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr6:25366563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:25367014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B15,B8,C3,C7
`Chr6:25372595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:25377722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:25378391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr6:25380018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:25380033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771147.1

815 aa

408

815

E1-E2_ATPase

Hydrolase

PF00122 E1-E2_ATPase 250-340 aa PF00702 Hydrolase 443-687 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771147.1`	Pfam	`PF00122`	E1-E2_ATPase	Domain	250	340	5.7e-23	81.4	P-type ATPase actuator domain
`XP_057771147.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	443	687	9.2e-21	75.8	haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915164.1
TACCCCCTTCCCCCCATATCCCCCAATCCTCGCCATCAGTCGACTCAGCTCAGCTCTACTGCTCTTCTTCTTCAACGATCAACAATCAAATTCATTGCTCTCACCTTCCTCTTCCCCACCATCCATGGAAGCTCTGTCTTTCCCATCTAAATCACGCTTCCTCTCCACCTCCCCCCAAATCACAAGACTCAAGCTCCACTTCAACAACAAATTTTCCTTTCATACAAAACCCAAACCCCCAATTCGCCTCCGCAACATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990945
ATGGAAGCTCTGTCTTTCCCATCTAAATCACGCTTCCTCTCCACCTCCCCCCAAATCACAAGACTCAAGCTCCACTTCAACAACAAATTTTCCTTTCATACAAAACCCAAACCCCCAATTCGCCTCCGCAACATCTCCTATTTCGCCTCCATTAAATGCTCGTCCCACTCCCACCATCACAGCCACAACGATCACCATAATCACAACCACGACCACAATCACAACCACCACCATCATCACCATCACCATCACAATCACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771147.1
MEALSFPSKSRFLSTSPQITRLKLHFNNKFSFHTKPKPPIRLRNISYFASIKCSSHSHHHSHNDHHNHNHDHNHNHHHHHHHHHNHGGCDANLTKSQQTFLRFAEAVKWTDLANFLREHLELCCCATALFLAAGACPHLLPKPVVAPLQHAFTAVAFPLVGVSASLDAALDLVGGKINIHVLMALAAFASVFMGNALEGGLLLAMFNLAHIAEEYFTSRSMVDVKELKENHPDFALQLDVENGNNPSFSDLKYHKVPVND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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