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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002841`

染色体: Chr06 坐标: 41173428-41179311 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002841`
名称	SmilChr06G002841
描述	uncharacterized SmilChr06G002841
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41173428 - 41179311 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990949`
GeneID	`130990949`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990949`
原始查询	`LOC130990949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.1; qcov=0.298; evalue=2.89e-40; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.4; qcov=0.579; evalue=8.31e-93; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990949

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771151.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771151.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771151.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771151.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771151.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41173463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:41173468`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	177	A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B2,B20,B21,B25,B28,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B48,B5,B50,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B7,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B79,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C36,C37,C38,C39,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C57,C58,C6,C61,C62,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D6,D7,D8,D9
`Chr6:41173485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr6:41174462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:41174529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B134,B51,B9,C38
`Chr6:41174656`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr6:41174656`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr6:41174658`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B13
`Chr6:41174658`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B13
`Chr6:41174663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C15,C25
`Chr6:41174734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:41174744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771151.1

1438 aa

719

1438

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 455-688 aa PF13966 zf-RVT 945-1024 aa PF13456 RVT_3 1154-1273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771151.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	455	688	2.1e-24	87.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057771151.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	945	1024	1.6e-15	58.2	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057771151.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1154	1273	1.5e-15	57.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915168.1
ATGCAAGTTCCCGCTAGTAAGCGCCGGGGGCGCCCAACTAAACAGGAACAAGCAGCCCGGGCGATCGGGAAAATTACTAAACATGCTGAGGACAGTATTAAGGCAAGGTTAAGAAACTCAGGTGAAACGGGGGTCAAATCTCGGGAGTTTATTATTGACAGTAGCAATAAGGAGAGTATCCAAGCTATGGATAACGTCGCGAAGGAAAGTTGGGCTGACGAGAGCTGGGATTTCCGAATTGCTGTTGTTCATGGGGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990949
ATGCAAGTTCCCGCTAGTAAGCGCCGGGGGCGCCCAACTAAACAGGAACAAGCAGCCCGGGCGATCGGGAAAATTACTAAACATGCTGAGGACAGTATTAAGGCAAGGTTAAGAAACTCAGGTGAAACGGGGGTCAAATCTCGGGAGTTTATTATTGACAGTAGCAATAAGGAGAGTATCCAAGCTATGGATAACGTCGCGAAGGAAAGTTGGGCTGACGAGAGCTGGGATTTCCGAATTGCTGTTGTTCATGGGGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771151.1
MQVPASKRRGRPTKQEQAARAIGKITKHAEDSIKARLRNSGETGVKSREFIIDSSNKESIQAMDNVAKESWADESWDFRIAVVHGANNHIDRRILWGDLSRFVSGRTIFIGDFNAVKGAHERLSLVSPHRGSCTEFCTFIDDTQMLESPTEGLRFTWSGRRFLPRHVESVLDRAFFSQEFADMWDSIVTSALPRLTSDHSPLVLQCRQNVPTGRSQFRFLNMWTSHSNFMDMVLASWNQSVDALCPILRVMLKLKRMRLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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