当前解析结果
SmilChr06G002842| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002842 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002842 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002842 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 41184596 - 41186326 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990957 |
|---|---|
| GeneID | 130990957 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990957 |
| 原始查询 | LOC130990957 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=27.7; qcov=0.497; evalue=4.9e-22; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990957 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771155.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057771155.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057771155.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771155.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771155.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:41184624 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B22,B73,C59,C75 |
Chr6:41184635 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B95,C59,C60 |
Chr6:41184638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C64,C78 |
Chr6:41184656 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr6:41184672 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B61,B68,C55 |
Chr6:41184679 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,C74,C8 |
Chr6:41184687 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B73,C59 |
Chr6:41184716 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,B19 |
Chr6:41184719 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr6:41184737 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr6:41184868 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B79 |
Chr6:41184869 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。