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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002952`

染色体: Chr06 坐标: 42327947-42330031 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002952`
名称	SmilChr06G002952
描述	receptor-like protein Cf-9 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42327947 - 42330031 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990976`
GeneID	`130990976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990976`
原始查询	`LOC130990976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein Cf-9 homolog
产物	receptor-like protein Cf-9 homolog
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=38.7; qcov=0.951; evalue=7.8e-86; confidence=medium
Rice	`Os01g0163000` - identity=40.9; qcov=0.883; evalue=3.09e-85; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990976

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771168.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771168.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771168.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771168.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42327951`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A1,A11,A14,A5,A9,B111,B117,B123,B128,B129,B132,B133,B137,B138,B14,B18,B21,B49,B5,B54,B58,B6,B62,B74,B76,B79,B88,C1,C11,C26,C43,C44,C5,C50,C53,C64,C66,C67,C69,C70,C76,C78,C9,D3
`Chr6:42327983`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B101,B69,B75
`Chr6:42327983`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B101,B69,B75
`Chr6:42328772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:42328791`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B119,B126,B21,C32,C68
`Chr6:42328791`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B119,B126,B21,C32,C68
`Chr6:42328802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B120,B25,B32,B61,B90,B92,C57,C63,C71,C72,C73,D9
`Chr6:42329017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr6:42329086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:42329093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:42329126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A1,A10,A11,A21,A23,A24,A3,A5,A8,B1,B102,B106,B107,B11,B112,B113,B119,B12,B124,B138,B16,B20,B23,B24,B28,B30,B33,B35,B41,B46,B52,B53,B61,B63,B67,B76,B78,B83,B89,B91,B94,B95,B96,C15,C17,C2,C21,C25,C3,C32,C4,C42,C46,C47,C48,C49,C54,C58,C62,C68,C8,C80,C83,C87,D2,D5,D8
`Chr6:42329170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771168.1

446 aa

223

446

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 39-60 aa PF00560 LRR_1 110-132 aa PF13855 LRR_8 110-169 aa PF00560 LRR_1 185-202 aa PF00560 LRR_1 251-271 aa PF13855 LRR_8 251-308 aa PF00560 LRR_1 273-295 aa PF13516 LRR_6 297-311 aa PF00560 LRR_1 298-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	39	60	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	110	132	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	110	169	1.8e-23	82.8	Leucine rich repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	185	202	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	251	271	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	251	308	1.8e-23	82.8	Leucine rich repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	273	295	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	297	311	5.7e-06	26.7	Leucine Rich repeat
`XP_057771168.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	298	319	3.8e-31	101.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915185.1
ATGCCAAAATATTTATCTCCTGAAGTCCTCATAACTCAAGCTTTGATTTCTCATGACTTGAATCATGATCCAGATGGTGGTCCAATTCCACCCGCCATTGGAAATCTATCACAGCTGAATTATTTAGGACTCCAATTCAACGAATTAAGTGGAGAAATCCCACCATCTATTTGCAACTTGAGATCCCTTCATGTTCTGCTCTTATGGAGTAACAAATTGAGAGGAGCAATTCCCCAGTGTTTGGGAAACCTCAACAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990976
ATGCCAAAATATTTATCTCCTGAAGTCCTCATAACTCAAGCTTTGATTTCTCATGACTTGAATCATGATCCAGATGGTGGTCCAATTCCACCCGCCATTGGAAATCTATCACAGCTGAATTATTTAGGACTCCAATTCAACGAATTAAGTGGAGAAATCCCACCATCTATTTGCAACTTGAGATCCCTTCATGTTCTGCTCTTATGGAGTAACAAATTGAGAGGAGCAATTCCCCAGTGTTTGGGAAACCTCAACAGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771168.1
MPKYLSPEVLITQALISHDLNHDPDGGPIPPAIGNLSQLNYLGLQFNELSGEIPPSICNLRSLHVLLLWSNKLRGAIPQCLGNLNSSLVVLHLSANQITSLQSTFTKDCSLQSLDINGNKLKGTLPQTLVNCQALRGIDLGDNEIRGAFPFWMETLPQLRVLILRSNKLDGEMSAASETEHPFPRLQVLDISRNAFSGSLPDRYFKNFRVMIDAKENMTGDHNDLYHQFINLTFTLKGLNQTLQRLLVTFTTIDLSMNRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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