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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003217`

染色体: Chr01 坐标: 50948363-50950789 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003217`
名称	SmilChr01G003217
描述	uncharacterized SmilChr01G003217
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50948363 - 50950789 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990981`
GeneID	`130990981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990981`
原始查询	`LOC130990981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834612]; symbol=AT5G45730; hit=AT5G45730; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834612]; symbol=AT5G45730; hit=AT5G45730; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G45730` (AT5G45730) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834612] identity=28.6; qcov=0.943; evalue=9.38e-42; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=30.5; qcov=0.287; evalue=3.75e-15; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771174.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771174.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771174.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771174.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50948404`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A19,A23,B1,B103,B104,B113,B117,B121,B123,B124,B126,B128,B130,B133,B14,B22,B25,B30,B41,B46,B51,B55,B65,B72,B78,B80,B81,B86,B91,B93,B98,B99,C36,C40,C43,C5,C57,C64,C65,C66,C7,C71,C79,C8,C80,C82,C84,C86,C87,D11,D4
`Chr1:50948411`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A10,A19,A23,B1,B103,B104,B113,B117,B121,B123,B124,B126,B128,B130,B133,B14,B22,B25,B30,B41,B46,B51,B55,B65,B72,B80,B81,B86,B91,B93,B98,B99,C36,C40,C43,C5,C57,C64,C65,C66,C7,C71,C79,C8,C80,C82,C84,C86,C87,D11,D4
`Chr1:50948444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:50948484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:50948581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B135,B16,B26,B75
`Chr1:50948617`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B122,B14,B38,B46,B47,B70,B71,C15,C2,C45,D4,D9
`Chr1:50948629`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr1:50948629`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr1:50948674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:50948694`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B122,B14,B2,B38,B47,B71,C2,C45,C85,D4
`Chr1:50948703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B91,C35,C5,C57
`Chr1:50948784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771174.1

652 aa

326

652

C1_2

PF03107 C1_2 9-61 aa PF03107 C1_2 72-119 aa PF03107 C1_2 137-182 aa PF03107 C1_2 194-247 aa PF03107 C1_2 319-375 aa PF03107 C1_2 528-573 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	9	61	3.8e-58	194.3	C1 domain
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	72	119	3.8e-58	194.3	C1 domain
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	137	182	3.8e-58	194.3	C1 domain
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	194	247	3.8e-58	194.3	C1 domain
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	319	375	3.8e-58	194.3	C1 domain
`XP_057771174.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	528	573	3.8e-58	194.3	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915191.1
TTGCACAATTCTCACATCATCACAACTCTATCTTTTTTGAGGAGCTTTTTATTTTATTTTCTCTTTTTTTGGAGCATCATCACAACTCCATCTTATTTTTGCTCTTTTATTCACATATACTTACTTATATGTAAATATGTTTTGGAACGTGCATAGATTGATCATGCATGTAATTTGCATTTATATCATGATATTTATTTTGGCATTATGTTTTCTTTAGTTTTGTGATATATATTCTCTTGAGATTTAGTTATGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990981
ATGGAGAAGAAGGTTATCACCAAATTCTACCATGAGCATCCTTTGATTTTCACAGATAATGTGAGTGTTAAGGATACTCCAAATTGTTATGGGTGTGGTGATCCCGTGACTAATTTAGAGTCGGCATATATTTGCATGCATCAACAAAATTGTAGCAATAGGATTATTCTCCACACTAAATGTGGAGAATTACCAAATCAAATTTCACACCATAAACACCCTCATCATTCTCTTGACCTATTTGATTACCATAATTTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771174.1
MEKKVITKFYHEHPLIFTDNVSVKDTPNCYGCGDPVTNLESAYICMHQQNCSNRIILHTKCGELPNQISHHKHPHHSLDLFDYHNFGKGYYNCDICRRDFGMVLGYHCSICGFDIDLMCEKLGIDALIEEKKELKHPSHPHHPLTLMRKPAFTFYCDGCGAQDVDMAYICSTCEFWVHKSCASLPLTLPVDRHHRHHHQLALAFSFPAEHRYNEFRYKCDVCDKDFDMTCWLYFCGDCRFFAHLKCATTKLDSDLDEENK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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