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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002969`

染色体: Chr06 坐标: 42516477-42517256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002969`
名称	SmilChr06G002969
描述	uncharacterized SmilChr06G002969
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42516477 - 42517256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990983`
GeneID	`130990983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990983`
原始查询	`LOC130990983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=75; qcov=0.359; evalue=9.67e-22; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=45.2; qcov=0.793; evalue=3.26e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771175.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057771175.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771175.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771175.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42516480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A11,A14,A3,A4,B1,B105,B111,B115,B121,B126,B130,B131,B135,B16,B18,B21,B25,B43,B46,B50,B51,B61,B63,B64,B70,C10,C22,C27,C32,C4,C5,C55,C57,C60,C69,C78,C79,C85,C9,D6
`Chr6:42516486`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,A4,B105,B135,B25,B61,B64,C5,C57
`Chr6:42516488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B29,B69,D10
`Chr6:42516493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,C31,C80,C85
`Chr6:42516507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A1,A13,A14,A16,A25,A5,A9,B1,B111,B113,B114,B117,B122,B123,B128,B129,B132,B133,B137,B138,B18,B21,B34,B35,B39,B45,B5,B51,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B66,B69,B71,B73,B74,B85,B87,B88,B9,C1,C11,C26,C43,C45,C5,C50,C53,C64,C66,C67,C69,C7,C76,C81,C84,C9,D5,D7
`Chr6:42516531`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	A10,A16,A19,A21,A23,A24,A7,A9,B100,B101,B111,B113,B115,B118,B122,B124,B126,B127,B132,B20,B25,B28,B29,B3,B32,B37,B49,B51,B53,B59,B64,B65,B7,B74,B80,B86,B89,B93,B98,B99,C13,C17,C18,C2,C24,C25,C3,C4,C42,C46,C48,C50,C51,C52,C58,C64,C67,C71,C73,C74,C77,C8,C84,D4,D6
`Chr6:42516535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B42,B43,B5,B50,B73,C19,C45
`Chr6:42516566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B39,B51,C1
`Chr6:42516566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B51,C1
`Chr6:42516651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B112,B128,B134,C38
`Chr6:42516651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B128,B134,C38
`Chr6:42516654`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A20,B111,B114,B76,B83,C13,C14,C35,C49,C5,C77,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771175.1

145 aa

145

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 2-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771175.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	56	1.1e-23	84.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915192.1
ATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGGCGATGAGCGACATCATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATCATCGAAGATGAAGGCGAGCACGCAACACAGTGGGAAGAAGACGCCGACGAAGCTTCAAGTAGCGCCGCATCTCAACCTCGTGCCGGTGCTCCGCCGGATTTTCATGCATTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990983
ATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGGCGATGAGCGACATCATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATCATCGAAGATGAAGGCGAGCACGCAACACAGTGGGAAGAAGACGCCGACGAAGCTTCAAGTAGCGCCGCATCTCAACCTCGTGCCGGTGCTCCGCCGGATTTTCATGCATTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771175.1
MQEAARKDIERAFGVLQARWAIVKGPSRLWSKEAMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEHATQWEEDADEASSSAASQPRAGAPPDFHAFVARQASMRNAEMHARLTLDLKEHIWSRFVLSLLMECKNLPGPTIYAAMQKFEDKSTRKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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