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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003222`

染色体: Chr01 坐标: 50981776-50992327 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003222`
名称	SmilChr01G003222
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50981776 - 50992327 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990993`
GeneID	`130990993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990993`
原始查询	`LOC130990993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
Arabidopsis	`AT3G53960` (AT3G53960) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824563] identity=24.9; qcov=0.852; evalue=5.11e-33; confidence=weak
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=25.9; qcov=0.769; evalue=6.13e-28; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771185.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771185.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057771185.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771185.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50981886`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A14,A7,A9,B108,B11,B120,B123,B124,B126,B133,B134,B24,B27,B30,B37,B45,B54,B55,B57,B7,B88,B9,B91,B96,C18,C21,C24,C26,C34,C43,C45,C49,C86,D1,D9
`Chr1:50982026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D7,D8
`Chr1:50982055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:50982086`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B45,B91,C49,D8
`Chr1:50982086`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B45,B91,C49,D8
`Chr1:50982091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B91,C49,D8
`Chr1:50982203`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr1:50982203`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr1:50982476`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B28,B46,B89,C21,D8
`Chr1:50982510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:50982890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:50984123`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B119,C17,C33,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771185.1

627 aa

314

627

PTR2

PF00854 PTR2 92-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771185.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	92	457	3.9e-15	56.4	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915202.1
CACAAAAAGATGTGGTTTTCACAGTCTATATGTATGAGCGACTTGAGAGGAAGATGAGTCAATTATGCCTAGATATAGAAATTAAAATCTCGTATTATACATTCAAGAAGTTAATATCTAATTTTGAAAAGTCTTTCTCACTATTGAGAACAGTTTGCAATTATCTAGAAGAGTGTACATGATCTTCCACATGCTAGCATCAATGAATTGATTATCAATAAATCATATTCCCTTTAGCCTCCATATCTTTTCTCTCTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990993
ATGAGGCACATCCAAGTCCTACAGTTGTGTCGGGAGAAGTTTCGTTACTACGTCGTCTTCACCCCCTCCATCTTTTTCATCTTAGGCCTCATATTCAGCTACAAGTTAGTGGAGAAGACATTTCTTAACATTTTGATCACGCGTCTCATCGAGGCGTGGGGGGAGGAGGAGTACGACCTCCGAAAAGGTGTAGTGGTAGTCAATTTGCAGGAAGGAACAAGCGCAGTTCTCGTTGTGCTGTTCTGTTATGTTGCCGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771185.1
MRHIQVLQLCREKFRYYVVFTPSIFFILGLIFSYKLVEKTFLNILITRLIEAWGEEEYDLRKGVVVVNLQEGTSAVLVVLFCYVADVYTGYFQMVVISTAVSIIGLLLNYLAAGNDDSGQLKLRLFYPALGLMALAQAAQTATLQAFLDDQLRPMDLDEDLRQRRSEFWWILVSFVAAIFAQFGPLPGFHFKKLAIVLIGVVGGCVLVFMLGTKYYYMVPTIPNPFKEVENVIARAIANRNLEYTLTTEPHVPWLRWLDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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