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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003221`

染色体: Chr01 坐标: 50976100-50977062 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003221`
名称	SmilChr01G003221
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50976100 - 50977062 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991000`
GeneID	`130991000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991000`
原始查询	`LOC130991000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.8-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.8-like
Arabidopsis	`AT1G72130` (AT1G72130) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843544] identity=29.7; qcov=0.549; evalue=6.97e-12; confidence=low
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=27.8; qcov=0.545; evalue=2.5e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771189.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771189.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057771189.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771189.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50976194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:50976252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr1:50976280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B63,B65,C14
`Chr1:50976294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:50976536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B66
`Chr1:50976624`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B109,B5,B78,B85,C6,C8,C82
`Chr1:50976639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:50976701`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B120,B2,C14,C4
`Chr1:50976701`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B120,B2,C14,C4
`Chr1:50976807`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A6,B120,B125,B138,B42,B49,B69,B80,B87,B93,B95,C14,C22,C28,C40,C48,C52,C70,C71,C77,C80,C83,C85,D9
`Chr1:50976809`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A6,B120,B125,B138,B42,B49,B69,B80,B87,B93,B95,C14,C22,C28,C40,C48,C52,C70,C71,C77,C80,C83,C85,D9
`Chr1:50976847`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A4,B101,B104,B40,B68,B75,B79,B9,B90,B92,C42,C48,C53,C55,C60,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915206.1
TGGAACCACCTTCTTCTACGAAGAAGCCAGCAGCCTTACTGAATACAATAATCCCATTCTCTTTCTCCACAATTAATCTGATGAGATTCACAACGGTCGCGGTCTCAGAAACGTCCAGCTACGTCGTCGGAAAACTTAAAGAGAAAAAGCAATACAACCAACAGAAGATGGAGCTGGTGCGAATCGGCATCGGAATGTCGTGCTGCGTGCTGTGCTGCCTTGCTGCTTTGGTGACAGCAACACGCAGGCAGTACGACACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991000
ATGAGATTCACAACGGTCGCGGTCTCAGAAACGTCCAGCTACGTCGTCGGAAAACTTAAAGAGAAAAAGCAATACAACCAACAGAAGATGGAGCTGGTGCGAATCGGCATCGGAATGTCGTGCTGCGTGCTGTGCTGCCTTGCTGCTTTGGTGACAGCAACACGCAGGCAGTACGACACGATCACCGTGTATTGGCTAACTCCTCAGTACTTTTTACTTGGACTAATGAGCGGACTCTCAGAAGATGGGCTTGAATCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771189.1
MRFTTVAVSETSSYVVGKLKEKKQYNQQKMELVRIGIGMSCCVLCCLAALVTATRRQYDTITVYWLTPQYFLLGLMSGLSEDGLESFYQSQVSESLSTFGPPFEEFVMGLGKFMSILCVLIFSRRPFKWFQSYIDNSSLNKYYILLAVLSFLNAQIYCLVACCYKDDAFLVEDEENGSPPQQVGDHIDQLLDSVAPRSIEGQNEQSSCADKISESSKINEVEVEKEEAMGIASSVEGQRISRRTVSKPRESSSGDVITEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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