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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003086`

染色体: Chr06 坐标: 43731123-43731674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003086`
名称	SmilChr06G003086
描述	uncharacterized SmilChr06G003086
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43731123 - 43731674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991009`
GeneID	`130991009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991009`
原始查询	`LOC130991009`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28.3; qcov=0.869; evalue=1.41e-06; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.9; qcov=0.94; evalue=8.95e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771196.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771196.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057771196.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771196.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43731129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B109,B115,B20,B50,B94,C2,C34,C51,C62,C84,D8
`Chr6:43731185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:43731193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C5
`Chr6:43731211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B10,B11,B31
`Chr6:43731211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B11,B31
`Chr6:43731218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C39
`Chr6:43731260`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,D10
`Chr6:43731260`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B10,D10
`Chr6:43731271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:43731288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D10
`Chr6:43731331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C5
`Chr6:43731362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771196.1

183 aa

183

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 13-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771196.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	13	106	4.8e-14	53.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915213.1
ATGGCTGGATTTGGAAGGCGACAAAGGAGGGGGGTTTTTTCAACCAAGTCGGCGTATGAAGTTATAGCAGCGGCCAGGAACGAACCTTCTCCGATGTCCATGTTTAAAGAGGAGTTAGCTCAAGTTTGGAAGACATCGGCACCACAGGCAAAGGTGACCGCATGGAGATGCTTGCGAAATAGGTTGACGACTTGCAATAACCTTGTCAAGAGGAATGTTACACTTGGGATTGAGGAGACGTGGTGTAATGCTTGCGTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991009
ATGGCTGGATTTGGAAGGCGACAAAGGAGGGGGGTTTTTTCAACCAAGTCGGCGTATGAAGTTATAGCAGCGGCCAGGAACGAACCTTCTCCGATGTCCATGTTTAAAGAGGAGTTAGCTCAAGTTTGGAAGACATCGGCACCACAGGCAAAGGTGACCGCATGGAGATGCTTGCGAAATAGGTTGACGACTTGCAATAACCTTGTCAAGAGGAATGTTACACTTGGGATTGAGGAGACGTGGTGTAATGCTTGCGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771196.1
MAGFGRRQRRGVFSTKSAYEVIAAARNEPSPMSMFKEELAQVWKTSAPQAKVTAWRCLRNRLTTCNNLVKRNVTLGIEETWCNACVTSVETAEHLFLHCPKVEIVWDKLQQWIDCKTVRPQGIPQHFTSFFCAARGQNIMKFLMAAWVCTIWLIWEKRNDSRFDGKAWDIEKLILEIKGRLWS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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