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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003161`

染色体: Chr06 坐标: 44566137-44589406 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003161`
名称	SmilChr06G003161
描述	uncharacterized SmilChr06G003161
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44566137 - 44589406 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991025`
GeneID	`130991025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991025`
原始查询	`LOC130991025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824202]; symbol=AT3G50380; hit=AT3G50380; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824202]; symbol=AT3G50380; hit=AT3G50380; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G50380` (AT3G50380) vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824202] identity=44.4; qcov=0.74; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os12g0594200` - identity=23.2; qcov=0.203; evalue=3.02e-21; confidence=weak
GO	GO:0006623 (protein targeting to vacuole); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0045053 (protein retention in Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF25036 (VPS13_VAB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057771209.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057771209.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057771209.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771209.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44566364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B10,B63,B84,C20
`Chr6:44566383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B135,B136,B69,C40
`Chr6:44566632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B69,C38
`Chr6:44567953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr6:44567983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr6:44568087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,D9
`Chr6:44568131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr6:44568188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B10,B63,B84,C20
`Chr6:44568208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C42
`Chr6:44568215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B10,B63,B84,C20
`Chr6:44568379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B63,B84,C20
`Chr6:44568513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B63,B84,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771209.1

2999 aa

1500

2999

VPS13_VAB

PF25036 VPS13_VAB 1916-2328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771209.1`	Pfam	`PF25036`	VPS13_VAB	Domain	1916	2328	4.6e-23	82.3	Vacuolar-sorting associated protein 13, adaptor binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915226.1
ATCATATTTCCTCTCAATTCAAGAAAACATTCATTCCCGATTCGCTTCAGCATCTCCCACAATGCCGAGAACAGAGTGAAAAGGGGAAATGTTTCTGCACGATTTTATTCAACGGAAGCTCGCAGCTCTGCTGCAGACATGGCTGAGAGGCGACTACGACCTCCAGCTCAAACTCGGCCTCCTCCGCTCAAGCGGCGCCCTCACCAACATCACCTTTGATACCGCCGCGCTCAACGAATTGCTGGACGACCCCTCCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991025
ATGTTTCTGCACGATTTTATTCAACGGAAGCTCGCAGCTCTGCTGCAGACATGGCTGAGAGGCGACTACGACCTCCAGCTCAAACTCGGCCTCCTCCGCTCAAGCGGCGCCCTCACCAACATCACCTTTGATACCGCCGCGCTCAACGAATTGCTGGACGACCCCTCCAAATTCTGCTTCAAGGAAGTCACCGTCGACCACGTCAGCCTGCAATTCGCGCCGTTTTCTTCCTCCGCATTCACTCTTGTGGTGCGCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771209.1
MFLHDFIQRKLAALLQTWLRGDYDLQLKLGLLRSSGALTNITFDTAALNELLDDPSKFCFKEVTVDHVSLQFAPFSSSAFTLVVRGVHIVLSLGEEEDEGGVRWTRRLKTVDTSAEERNKVLKDIDPEGCALHDAIKKISDISTRTWRDSLWNTVTRHCQLLLHDVNVLLQYPCLHDVPLCSLYLKKFGAASQILGQRCFIRGFMNSFSLPFEESSFDVDFNGFEVTLNSQNRRTTVFPATNMSALVNLNSLQSVNFSFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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