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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003173`

染色体: Chr06 坐标: 44670952-44673144 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003173`
名称	SmilChr06G003173
描述	putative B3 domain-containing protein Os03g0621600
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44670952 - 44673144 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991027`
GeneID	`130991027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991027`
原始查询	`LOC130991027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative B3 domain-containing protein Os03g0621600
产物	putative B3 domain-containing protein Os03g0621600
Arabidopsis	`AT4G31650` (AT4G31650) Transcriptional factor B3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829293] identity=32; qcov=0.422; evalue=2.09e-10; confidence=low
Rice	`Os03g0621600` - identity=25.7; qcov=0.959; evalue=1.15e-12; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771211.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771211.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771211.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771211.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44671265`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B111,B90,B92,C21,C22,C33,C72
`Chr6:44671297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B138
`Chr6:44671301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr6:44671309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C43
`Chr6:44671393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr6:44671404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr6:44671629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:44671665`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A14,A23,B105,B111,B124,B15,B20,C22,C29,C42,C5,C56,C57,C58
`Chr6:44671824`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A23,B105,B111,B124,B137,B15,B20,C22,C29,C42,C5,C56,C57,C58,C78
`Chr6:44671953`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B16,B19,C35,C40,C64,C66,C81
`Chr6:44671957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:44671961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771211.1

296 aa

148

296

PF02362 B3 21-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771211.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	21	100	5.4e-26	91.2	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915228.1
CCAACCCACGCCTATACGAAAAGAAAAGGCCTCATTTGCTACACTATTTCTTTTTCTGAAAGGTAGAAATCAAAATGGTGACATCTTTTCAAGACCCAACTCCTTCCTTCATGATGTTATGCCTTGGGGATTTTTCCTCCAACTTGTGTATACCAACAAAGTTCATGACCAAATACAGACAAGCTGTGCAGCATTCAGTAGTTCTAGAAACTGAATATTCCCCAACAAGTTGGGATGTGAAGATCAAAAATTTGAGTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991027
ATGGTGACATCTTTTCAAGACCCAACTCCTTCCTTCATGATGTTATGCCTTGGGGATTTTTCCTCCAACTTGTGTATACCAACAAAGTTCATGACCAAATACAGACAAGCTGTGCAGCATTCAGTAGTTCTAGAAACTGAATATTCCCCAACAAGTTGGGATGTGAAGATCAAAAATTTGAGTTCGGATTTTTACATGACAGATGGTTGGTCGGAATTCGTGAAAGACAACCAACTTGGTGAACTCGACTTCCTCACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771211.1
MVTSFQDPTPSFMMLCLGDFSSNLCIPTKFMTKYRQAVQHSVVLETEYSPTSWDVKIKNLSSDFYMTDGWSEFVKDNQLGELDFLTFRFMAESTFRVSIYGGDGCPKHPTPMSSRGGDVDKIENGMTKGKRGTKLYILPSFFFRLIVIMFGLIHQFWPKFVFDAYLKKEIPPSRSAHDVNESGIKRGSVRPPKRKIEGNPLCFEARMKPYHNSSISLPQAFSRAANMEMKRQVRVEFEGNRHGFCVAVYPKRRRPTIELT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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