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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003194`

染色体: Chr06 坐标: 44829212-44830519 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003194`
名称	SmilChr06G003194
描述	uncharacterized SmilChr06G003194
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44829212 - 44830519 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991028`
GeneID	`130991028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991028`
原始查询	`LOC130991028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=53.7; qcov=0.984; evalue=1.28e-163; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=35.4; qcov=0.545; evalue=1.29e-39; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771212.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771212.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771212.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771212.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771212.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44829293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B10,B104,B107,B109,B129,B16,B69,B91,C3,C44
`Chr6:44829354`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B136,C57
`Chr6:44829354`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B136,C57
`Chr6:44829372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C57
`Chr6:44829421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C24
`Chr6:44829449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B12,B46
`Chr6:44829478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B78,C45,D4
`Chr6:44829504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:44829508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B130,B14,C32
`Chr6:44829522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A4,B100,B41,C11,C13,C37,C69,D4
`Chr6:44829677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:44829683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771212.1

435 aa

218

435

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 348-406 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771212.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	348	406	3.2e-08	34.0	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915229.1
ATGAGAGGTGAATTCAGTGGATTGAAAACTTTGATACTTAAGAGGAATCCTAATGCTTATTATGTTCATTGTTTTGCTCATCAGCTTCAACTAACAATTGTTGCTGTTGCAAAAAAACATATCATTGTTGGGTCTTTCTTTAATACTATCTCGCGCTTATGCAATGTGGTTGGAGGTTCATGTAAGCGCAGGGATATGCTTCGAGAGAGCCAAAGAGAGAAGATTATTGAAGGCATTGCAAGTGATGAAATTAAGACAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991028
ATGAGAGGTGAATTCAGTGGATTGAAAACTTTGATACTTAAGAGGAATCCTAATGCTTATTATGTTCATTGTTTTGCTCATCAGCTTCAACTAACAATTGTTGCTGTTGCAAAAAAACATATCATTGTTGGGTCTTTCTTTAATACTATCTCGCGCTTATGCAATGTGGTTGGAGGTTCATGTAAGCGCAGGGATATGCTTCGAGAGAGCCAAAGAGAGAAGATTATTGAAGGCATTGCAAGTGATGAAATTAAGACAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771212.1
MRGEFSGLKTLILKRNPNAYYVHCFAHQLQLTIVAVAKKHIIVGSFFNTISRLCNVVGGSCKRRDMLRESQREKIIEGIASDEIKTGRGLNQEMGMKRPGDTRWSSHYGTLINLIHLFTSIVDVLEYVGANGSDDSQKSEAMDLLDVISRFEFVFVLHLMKKILGITHDLSQVLQRKEQDIVNAMKLVNVAKTRLQAMREKEWEMMLADISKFCSRNEIEMLDMDGEYAPRGRGRRRVEKMTNLHHYRVELFYTVIDMQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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