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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003198`

染色体: Chr06 坐标: 44848626-44849539 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003198`
名称	SmilChr06G003198
描述	uncharacterized SmilChr06G003198
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44848626 - 44849539 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991030`
GeneID	`130991030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991030`
原始查询	`LOC130991030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0104700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os10g0104700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.3; qcov=0.633; evalue=4.55e-08; confidence=low
Rice	`Os10g0104700` - identity=22.6; qcov=0.992; evalue=7.08e-11; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771215.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771215.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771215.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771215.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44848631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C79
`Chr6:44848635`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr6:44848635`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C32
`Chr6:44848640`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C32
`Chr6:44848640`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C32
`Chr6:44848652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr6:44848668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr6:44848690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A15,B135
`Chr6:44848708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D3
`Chr6:44848718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B42,B43,C15,C47
`Chr6:44848748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D2
`Chr6:44848768`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,B130,B97,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771215.1

237 aa

118

237

SWIM

PF04434 SWIM 87-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771215.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	115	1e-09	38.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915232.1
ATGACGTCTAATGCAGCGGAATCTTTTAACTCTCGGTTGTGGTGGGCTAGGCGTTTACCAATGTGCTCTTTACTTGAATCGTTTCGCACACTTTTGGAGGATTGGTTTGACGAGCAACGTACATCGTCTGAATCGAGAGATCGTGTGTTAACGGTGTCTACTTTCAACAAGCTATCTAATTCTGTGCAAGCAAGTCTCTCTCTTACTGTTCGAGCCACCATCGGACTTGTGTATAAAGTTGATGAGGATGATCAACAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991030
ATGACGTCTAATGCAGCGGAATCTTTTAACTCTCGGTTGTGGTGGGCTAGGCGTTTACCAATGTGCTCTTTACTTGAATCGTTTCGCACACTTTTGGAGGATTGGTTTGACGAGCAACGTACATCGTCTGAATCGAGAGATCGTGTGTTAACGGTGTCTACTTTCAACAAGCTATCTAATTCTGTGCAAGCAAGTCTCTCTCTTACTGTTCGAGCCACCATCGGACTTGTGTATAAAGTTGATGAGGATGATCAACAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771215.1
MTSNAAESFNSRLWWARRLPMCSLLESFRTLLEDWFDEQRTSSESRDRVLTVSTFNKLSNSVQASLSLTVRATIGLVYKVDEDDQQYQVDLQNWTCECREFDEDKIPCKHAVAAIRWAGNGLNVYDFVHKYFKQYELTQTYAEHLKDYPHDGVKCALGVMEQDTIEKKCTISIPVGGVDLNVPFQEAEFEETSHATDEPSHDTEEAQPTQRRRKKKRCSNCGEEGHDIRACPMLFRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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