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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003242`

染色体: Chr06 坐标: 45115804-45116900 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003242`
名称	SmilChr06G003242
描述	reticulon-like protein B13
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45115804 - 45116900 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991032`
GeneID	`130991032`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991032`
原始查询	`LOC130991032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B13
产物	reticulon-like protein B13
Arabidopsis	`AT2G23640` (RTNLB13) Reticulan like protein B13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816896] identity=33.5; qcov=0.878; evalue=7.4e-39; confidence=low
Rice	`Os05g0526400` - identity=30.6; qcov=0.714; evalue=3.44e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991032

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771217.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057771217.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057771217.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771217.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45115811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr6:45115882`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr6:45115882`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45115910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B13
`Chr6:45115916`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A13,A19,A2,A3,A5,A7,A9,B101,B106,B107,B108,B119,B123,B13,B134,B138,B15,B23,B25,B28,B30,B36,B48,B49,B65,B72,B85,B93,B94,B95,C1,C21,C24,C27,C31,C37,C41,C43,C47,C55,C6,C61,C75,C78,C82,C84,C9,D10,D11,D7
`Chr6:45115921`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A13,A19,A2,A3,A7,A9,B101,B106,B107,B108,B119,B123,B13,B134,B138,B15,B23,B25,B28,B30,B36,B48,B49,B65,B72,B85,B93,B94,B95,C1,C21,C24,C27,C31,C37,C41,C43,C47,C55,C6,C61,C75,C78,C82,C84,C9,D10,D11,D7
`Chr6:45115929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B82
`Chr6:45115944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C74
`Chr6:45116128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:45116133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:45116193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:45116253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771217.1

238 aa

119

238

Reticulon

PF02453 Reticulon 48-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771217.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	48	202	3.5e-37	128.4	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915234.1
ATGTCCGAATTAACATCGGAATCTCCGACCTCGCCGCCGCCAAAAGCTGACCTGCATAAAAACCAAGCAACATCGGAATCTCCGACCTCGACCCCGCCGCCGCCAGAAGTAGCTCAACTCCATAGCAACACAGATTTACTAAGCGACGTGCTGCTATGGAGAAGGAAGCAACTGAATGTCGGAATCCTTGCAGCGGCAGCCGCCACGTGGATCGTCATCGATGTCTACCAATACACTTTTATCACAGTCCTCTCTTGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991032
ATGTCCGAATTAACATCGGAATCTCCGACCTCGCCGCCGCCAAAAGCTGACCTGCATAAAAACCAAGCAACATCGGAATCTCCGACCTCGACCCCGCCGCCGCCAGAAGTAGCTCAACTCCATAGCAACACAGATTTACTAAGCGACGTGCTGCTATGGAGAAGGAAGCAACTGAATGTCGGAATCCTTGCAGCGGCAGCCGCCACGTGGATCGTCATCGATGTCTACCAATACACTTTTATCACAGTCCTCTCTTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771217.1
MSELTSESPTSPPPKADLHKNQATSESPTSTPPPPEVAQLHSNTDLLSDVLLWRRKQLNVGILAAAAATWIVIDVYQYTFITVLSWLAMALLTCFFFWGNMHRFLNKEAPDLSELEISEETATAQARLLRQRAEDGIRLMFHVGGEREWFVFLGAVASLYLVALAAQHLDFVTLCFIGILGAMTVPAIYVKNEQKIVEFAKNVRVRWQRLNVMIEEKLQKVKNKFAGKQKEVKEKKTQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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