当前解析结果
SmilChr06G003272| 统一新 Gene ID | SmilChr06G003272 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G003272 |
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 45317026 - 45318633 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991033 |
|---|---|
| GeneID | 130991033 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991033 |
| 原始查询 | LOC130991033 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| 产物 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like |
| Arabidopsis | AT4G38180 (FRS5)FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.8; qcov=0.811; evalue=1.43e-54; confidence=low |
| Rice | Os06g0166100- identity=36.2; qcov=0.897; evalue=5.44e-80; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991033 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771218.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057771218.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771218.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771218.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771218.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771218.1PF03101
FAR1 102-191 aa
PF21056
ZSWIM1-3_RNaseH-like 286-396 aa
PF10551
MULE 315-409 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771218.1 |
Pfam | PF03101 |
FAR1 | Domain | 102 | 191 | 6.5e-17 | 62.8 | FAR1 DNA-binding domain |
XP_057771218.1 |
Pfam | PF21056 |
ZSWIM1-3_RNaseH-like | Domain | 286 | 396 | 5.9e-07 | 30.2 | Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain |
XP_057771218.1 |
Pfam | PF10551 |
MULE | Domain | 315 | 409 | 2.3e-26 | 92.7 | MULE transposase domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。