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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003273`

染色体: Chr06 坐标: 45320267-45321049 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003273`
名称	SmilChr06G003273
描述	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45320267 - 45321049 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991034`
GeneID	`130991034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991034`
原始查询	`LOC130991034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
产物	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
Arabidopsis	`AT1G53490` (HEI10) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841784] identity=38.6; qcov=0.825; evalue=5.85e-23; confidence=medium
Rice	`Os02g0232100` (HEI10) - identity=32; qcov=0.956; evalue=4.29e-22; confidence=low
GO	GO:0051026 (chiasma assembly)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771219.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057771219.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057771219.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057771219.1`
5	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057771219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45320292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C34
`Chr6:45320363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B109,B126,B30,B46,B61,B77,C24,C28,C51,C52
`Chr6:45320384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B63,C37
`Chr6:45320420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C48,C58
`Chr6:45320430`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B109,B126,B30,B77,C24,C28,C51,C52
`Chr6:45320433`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B109,B126,B30,B77,C24,C28,C51,C52
`Chr6:45320458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B46,C8,D2
`Chr6:45320555`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B118,B136,B32,B34,B44,B48,B69,C48,C58,C7,C72,C79,D6
`Chr6:45320589`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	151	A14,A15,A16,A19,A2,A20,A22,A24,A4,A8,A9,B1,B100,B101,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B121,B123,B125,B127,B129,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B24,B25,B29,B3,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B59,B60,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B80,B81,B82,B85,B88,B90,B92,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C12,C14,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C24,C26,C28,C31,C35,C36,C38,C4,C42,C44,C47,C52,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C69,C70,C72,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C82,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr6:45320631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr6:45320676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B17
`Chr6:45320777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915236.1
ATGGAGATGGAATGGAAGTTCAATACAGCACGGAATCCGATTCTGCAAAACCATGAGAAACTTAAACAGAAATTGGAGGAGGCAGTTGGTGCGTACCAGAAAATTAGTGAGAGGTGCGGGATACTTGAGTTGGAGAATGAGAAGCTTTCCAAGGAAATACTGCAACTGCAAGAAAAGTTTTCAGAATTAAGCAGGCAGAAAAGGAAACTCGATGAAATGAACAATCAAACAATAAAGGAAATTGAGTCATTGTATCGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991034
ATGGAGATGGAATGGAAGTTCAATACAGCACGGAATCCGATTCTGCAAAACCATGAGAAACTTAAACAGAAATTGGAGGAGGCAGTTGGTGCGTACCAGAAAATTAGTGAGAGGTGCGGGATACTTGAGTTGGAGAATGAGAAGCTTTCCAAGGAAATACTGCAACTGCAAGAAAAGTTTTCAGAATTAAGCAGGCAGAAAAGGAAACTCGATGAAATGAACAATCAAACAATAAAGGAAATTGAGTCATTGTATCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771219.1
MEMEWKFNTARNPILQNHEKLKQKLEEAVGAYQKISERCGILELENEKLSKEILQLQEKFSELSRQKRKLDEMNNQTIKEIESLYRSAIKRANLSFAHWSALTADTPGPSSHPSFGAGVGSRANSLMSLKDHILSPSYNASRARHNNSNRPFDMSGGSPAKRSAVPTRAESGKGVPSSHPSFGGVWITPSKSFKKESFTHTAAPTLPWLRARVHVSPLTGKSSRKSINC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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