当前解析结果
SmilChr06G002033| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002033 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002033 |
| 描述 | triacylglycerol lipase OBL1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 26514016 - 26525945 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991039 |
|---|---|
| GeneID | 130991039 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991039 |
| 原始查询 | LOC130991039 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | triacylglycerol lipase OBL1-like |
| 产物 | triacylglycerol lipase OBL1-like |
| Arabidopsis | AT5G42930 (AT5G42930)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834305] identity=44; qcov=1.03; evalue=2.72e-135; confidence=medium |
| Rice | Os02g0767200- identity=42.5; qcov=1.02; evalue=7.5e-121; confidence=medium |
| GO | GO:0004806 (triacylglycerol lipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01764 (Lipase_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991039 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057771222.1 |
| 2 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057771222.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057771222.1 |
| 4 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.20000 | XP_057771222.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771222.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:26514339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,C48 |
Chr6:26514913 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B9,C38 |
Chr6:26514921 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,D3 |
Chr6:26514961 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr6:26515094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr6:26515191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr6:26515245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B137,B55,C2 |
Chr6:26519142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr6:26519202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr6:26525753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr6:26525819 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr6:26525872 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B121,B13,C2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771222.1PF01764
Lipase_3 202-350 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771222.1 |
Pfam | PF01764 |
Lipase_3 | Domain | 202 | 350 | 9.4e-34 | 117.0 | Lipase (class 3) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。