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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000005`

染色体: Chr07 坐标: 10656-15692 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000005`
名称	SmilChr07G000005
描述	uncharacterized SmilChr07G000005
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10656 - 15692 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991192`
GeneID	`130991192`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991192`
原始查询	`LOC130991192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946]; symbol=AT3G07565; hit=AT3G07565; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946]; symbol=AT3G07565; hit=AT3G07565; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07565` (AT3G07565) histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946] identity=56.5; qcov=0.604; evalue=3.48e-42; confidence=medium
Rice	`Os05g0305700` - identity=46.1; qcov=0.539; evalue=1.76e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12579 (DUF3755)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991192

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771268.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771268.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771268.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771268.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:12287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771268.1

245 aa

122

245

DUF3755

PF12579 DUF3755 181-219 aa

XP_057771269.1

238 aa

119

238

DUF3755

PF12579 DUF3755 181-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771268.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	181	219	2.6e-08	34.1	Protein of unknown function (DUF3755)
`XP_057771269.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	181	213	3.4e-11	43.3	Protein of unknown function (DUF3755)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915286.1
TGTGTCATGTGTATGCATATATGAAGAGATGTTCTATATTCACACGCGTGCTACCAAAATATATAAATAGGCACACAAAAAGTAGCTTCCATTTGTATTTGTATACTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTTTCCTACGTGCACTTCAGATTCCATCTTACTTTTACTTCCCCTCTTCACCTTCCCACCAGTTCAATTTTTTCAGTAGCTTAAAGAATCTTTGAGCTGCAAAAAAAGAAAAACAAAAACCACTCTTG...

XM_057915285.1
TGTGTCATGTGTATGCATATATGAAGAGATGTTCTATATTCACACGCGTGCTACCAAAATATATAAATAGGCACACAAAAAGTAGCTTCCATTTGTATTTGTATACTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTTTCCTACGTGCACTTCAGATTCCATCTTACTTTTACTTCCCCTCTTCACCTTCCCACCAGTTCAATTTTTTCAGTAGCTTAAAGAATCTTTGAGCTGCAAAAAAAGAAAAACAAAAACCACTCTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991192
ATGATGGCTAGCTCAAGTGGGACCTTCAAAGAAGGGGTTAACAAGCAAGCTCATAACTCTGTTTCTTCGTCCTACAATGGCGGCTCTGTGCATGGAGAGTGGGGTGTGCCAACTTTTCAGCATCAGCAGACCATTTCCATGGACTGGACTCCTGAAGAGCAAGCTCTCTTGGAGGAGGGTTTGGCCAAATATGCCACAGAGTCGAACATCATCCGTTATGCAAAGATCGCTGTGCAGCTAAAGAACAAGACTGTTCGAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771268.1
MMASSSGTFKEGVNKQAHNSVSSSYNGGSVHGEWGVPTFQHQQTISMDWTPEEQALLEEGLAKYATESNIIRYAKIAVQLKNKTVRDVALRCRWMTKKEISKRRKEDFNARKSKDRKEKFIDSTAKPSRLSIQSGLSQAPGMVSNCNDDSISYNDLTGATRQLLQHNAWTFKQISANLSTHQIHENIGLLSQARDNIFKILTNVDWVDCSLNDMGPTMKRMPQLPKLNEELANSILPSTNFPIQL

XP_057771269.1
MMASSSGTFKEGVNKQAHNSVSSSYNGGSVHGEWGVPTFQHQQTISMDWTPEEQALLEEGLAKYATESNIIRYAKIAVQLKNKTVRDVALRCRWMTKKEISKRRKEDFNARKSKDRKEKFIDSTAKPSRLSIQSGLSQAPGMVSNCNDDSISYNDLTGATRQLLQHNAWTFKQISANLSTHQIHENIGLLSQARDNIFKILTNLNDMGPTMKRMPQLPKLNEELANSILPSTNFPIQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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