当前解析结果
SmilChr07G000008| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000008 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000008 |
| 描述 | probable mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM21 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28082 - 30280 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991197 |
|---|---|
| GeneID | 130991197 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991197 |
| 原始查询 | LOC130991197 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM21 |
| 产物 | probable mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM21 |
| Arabidopsis | AT4G00026 (SD3)import inner membrane translocase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770411] identity=69.2; qcov=0.83; evalue=8.36e-62; confidence=high |
| Rice | Os03g0253800- identity=71.9; qcov=0.858; evalue=1.11e-63; confidence=high |
| GO | GO:0005744 (TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08294 (TIM21) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991197 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057771276.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057771276.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.20000 | XP_057771276.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771276.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771276.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28585 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr7:28735 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,A20 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771276.1PF08294
TIM21 30-126 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771276.1 |
Pfam | PF08294 |
TIM21 | Domain | 30 | 126 | 1.2e-16 | 61.6 | TIM21 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。