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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000020`

染色体: Chr07 坐标: 96941-98358 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000020`
名称	SmilChr07G000020
描述	non-specific lipid-transfer protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	96941 - 98358 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991210`
GeneID	`130991210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991210`
原始查询	`LOC130991210`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid-transfer protein 2-like
产物	non-specific lipid-transfer protein 2-like
Arabidopsis	`AT3G51590` (LTP12) lipid transfer protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824322] identity=46.6; qcov=0.803; evalue=1.17e-27; confidence=medium
Rice	`Os12g0115300` (OsLTP1.19) - identity=56.2; qcov=0.653; evalue=1.64e-31; confidence=medium
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057771295.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057771295.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771295.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771295.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:97139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B4,B97
`Chr7:97858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:97885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:97902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr7:97903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C65
`Chr7:97999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:98156`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A1,A2,B108,B27,B35,B50,B91,B94,C5,C52,C59,C65
`Chr7:98161`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	161	A10,A11,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B131,B132,B134,B136,B138,B139,B140,B16,B17,B18,B2,B21,B23,B25,B27,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B47,B52,B53,B56,B57,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B93,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C33,C34,C35,C36,C37,C40,C44,C45,C48,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C73,C76,C78,C8,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:98165`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	65	A19,A20,A21,A24,A4,A8,B111,B120,B122,B124,B126,B13,B132,B138,B14,B21,B23,B25,B30,B31,B37,B42,B43,B45,B47,B52,B56,B61,B68,B71,B73,B74,B76,B78,B8,B80,B82,B85,B86,B87,B96,B99,C13,C14,C19,C25,C26,C28,C29,C34,C35,C36,C42,C48,C52,C53,C57,C58,C62,C63,C73,D11,D3,D8,D9
`Chr7:98177`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr7:98177`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr7:98181`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	95	A1,A15,A2,A21,A24,A6,A9,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B115,B12,B121,B123,B126,B129,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B15,B20,B21,B24,B26,B28,B32,B40,B41,B44,B47,B48,B49,B5,B54,B55,B56,B58,B60,B66,B68,B74,B75,B77,B79,B80,B84,B85,B86,B87,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C26,C27,C28,C32,C33,C36,C39,C40,C41,C46,C50,C53,C55,C59,C60,C61,C68,C7,C70,C74,C75,C78,C80,C81,C82,C87,C9,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771295.1

147 aa

147

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 42-135 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 60-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771295.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	42	135	1.8e-08	35.1	Probable lipid transfer
`XP_057771295.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	60	143	9.3e-16	58.6	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915312.1
ATGATTGGGCCATGCACAAATTAATTCATCTTCCTAACTGTAAACTACAACCATAAATTCCCATCACAAATTCAATCAACACTTCACCAAATCGTCTCTATAAAAAGAAACATAATTTTATGCATGTCAAACACACAAACTCACTCACACACAAAAATAGTAACTCAGGTGCTTCTACACATACCAAAAAACAAAACAAAAATTATAGCAATGGCTGCCATAATGAAGCCAATCAGCATGCTCCTCATCGCCGCCGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991210
ATGTCAAACACACAAACTCACTCACACACAAAAATAGTAACTCAGGTGCTTCTACACATACCAAAAAACAAAACAAAAATTATAGCAATGGCTGCCATAATGAAGCCAATCAGCATGCTCCTCATCGCCGCCGTGATGATGGTGGCAGTGGCACCGCGGAGCGAGGCGGCGATCGGGTGCGGCTCGGTGGTTTCTTACCTGAACCCTTGCGTCCCATACGTGACAAACAAGGGCCCCATGGGAGGCTGCTGCAATGGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771295.1
MSNTQTHSHTKIVTQVLLHIPKNKTKIIAMAAIMKPISMLLIAAVMMVAVAPRSEAAIGCGSVVSYLNPCVPYVTNKGPMGGCCNGVKGLYSAAKTTPDRQSVCGCLKSLAGSYSGVDYGKAAALPGQCGVSIPYKISPSTDCSKVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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