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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000064`

染色体: Chr07 坐标: 296246-299283 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000064`
名称	SmilChr07G000064
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	296246 - 299283 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991256`
GeneID	`130991256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991256`
原始查询	`LOC130991256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog
Arabidopsis	`AT1G06650` (AT1G06650) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837175] identity=48.1; qcov=0.997; evalue=2.6e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0690500` - identity=44.4; qcov=0.989; evalue=2.37e-99; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771349.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771349.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771349.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771349.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:296306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B8,B88,C54
`Chr7:296321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C76
`Chr7:296359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:296391`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,B20,B63,C10
`Chr7:296391`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A21,B20,B63,C10
`Chr7:296402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C35,C39,D9
`Chr7:296512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C40
`Chr7:296529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C18,C2
`Chr7:296553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:296629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B32,B82,C74,D3
`Chr7:296738`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B79,C63,D1
`Chr7:296738`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B79,C63,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771349.1

369 aa

184

369

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 63-162 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 221-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771349.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	63	162	5.9e-21	76.0	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057771349.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	221	315	5.9e-31	107.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915366.1
TGTAGAAACAGATAGAAAAAAAAAATCCAAAAACAGCAGTAAAACCAAAAAGAAATGGCAGATTCATCAGCTATTGATCAGCAATACGATCGAATGCAAATGCTCAAAGCTTTCGACGAAACAAAAGCCGGCGTCAAAGGCCTCAACGATTCAGGTCTGTTCAAACTCCCAGAAATCTTCGTGAGGCCATCGGAGGAGCTGATTGCAGATCTAAAACACGAAATTGCTCATCAATTTCAAGTTCCCGTGATCGATCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991256
ATGGCAGATTCATCAGCTATTGATCAGCAATACGATCGAATGCAAATGCTCAAAGCTTTCGACGAAACAAAAGCCGGCGTCAAAGGCCTCAACGATTCAGGTCTGTTCAAACTCCCAGAAATCTTCGTGAGGCCATCGGAGGAGCTGATTGCAGATCTAAAACACGAAATTGCTCATCAATTTCAAGTTCCCGTGATCGATCTGAGCGGCGTCGACGATTCCGCTAGAAGAAAGCAGATCGTTGAAGAAGTGAGAAGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771349.1
MADSSAIDQQYDRMQMLKAFDETKAGVKGLNDSGLFKLPEIFVRPSEELIADLKHEIAHQFQVPVIDLSGVDDSARRKQIVEEVRSAAETWGFFQVVNHGIPRSVCDGMIDGVRDFNEQDVDLKKKYYSRDTTRSVRYHSSYDLFMSRTASWKDTLTIAFNSGSDLLDHQELPPICRDSTVEYSKHVEILGNILLGVLSEALGLEAEFLRTNMECSKGHRLHCHYYPPCPEPELAIGTPKHSDAGFLTVLLQNQLLSGLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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