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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000087`

染色体: Chr07 坐标: 453118-460442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000087`
名称	SmilChr07G000087
描述	uncharacterized SmilChr07G000087
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	453118 - 460442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991283`
GeneID	`130991283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991283`
原始查询	`LOC130991283`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	At domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834276]; symbol=AT5G42670; hit=AT5G42670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	At domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834276]; symbol=AT5G42670; hit=AT5G42670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G42670` (AT5G42670) At domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834276] identity=48.4; qcov=0.537; evalue=5.93e-53; confidence=medium
Rice	`Os05g0140600` - identity=40.9; qcov=0.44; evalue=2.57e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771377.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771377.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771377.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771377.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:453722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,D9
`Chr7:453897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:453929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B90,B92,C64,C66
`Chr7:453957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:453963`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A9,C36,C57
`Chr7:453963`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A9,C36,C57
`Chr7:453985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A13,A14,A25,A9,B103,B111,B114,B123,B133,B139,B19,B2,B28,B35,B37,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B8,B83,B89,C14,C15,C2,C22,C28,C32,C36,C45,C46,C49,C50,C53,C57,C67,C68,C7,C70,C72,C76,D1,D8
`Chr7:454132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B57,B70,C38
`Chr7:454133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:454140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:456222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B50,C52,C55
`Chr7:457444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771377.1

350 aa

175

350

Agenet

PF05641 Agenet 9-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771377.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	9	81	2.1e-07	32.0	Agenet domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915394.1
TCTTCTTCTTTTTCTCCTTCTTCCTCACCCCTTTCTTCCTCCGCGGCTCTCCTTCTCTCATCTCTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTATTTTTCACGCGTGTCTGCACGCGAATACATTTCCTCCTCAACCTTCGCGTCCAGCACGAGCAGCTGCAGTACTCCAAGGCGGCGATCTCCATGCACATTATTGGTTTTAACTTCCATGGAGAACATACCGTTTAAGGCTGGACAACTGGCCGAATTAAGGTCTTTTGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991283
ATGGAGAACATACCGTTTAAGGCTGGACAACTGGCCGAATTAAGGTCTTTTGGTTTTGGTTATCGTGGTGCGTGGTTTCGATGCAAGATTAAAGAGTTCACAGAGAGAAATGGAATGCTTGGACATATCTCGGAATACTATGACTACGCGGATGAAAAATTAACTTGGACTAAGCTATATCAGCTACCCATCGGGAACACAAAAAGGAAACATAGCGAATTGATGATGAGGCCACAGTACCCTCCTATCTGTAATGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771377.1
MENIPFKAGQLAELRSFGFGYRGAWFRCKIKEFTERNGMLGHISEYYDYADEKLTWTKLYQLPIGNTKRKHSELMMRPQYPPICNEKQMPHVSEISEVTVIVCDSWKVGDLVDLFHTGCYWCGRITQLFDDQKAQIELRPPPLGEGSSYKALLKDLRPSLDWSLQHGWTLPTQEDGFGHPCARLVKPINRGIEDVSIFAGLHARLLSFPHVSSNTSTPLSEVKSTNTLEINKRLCGTTLTKEQKNDIEKSASHGCGESNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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