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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000104`

染色体: Chr07 坐标: 560464-565157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000104`
名称	SmilChr07G000104
描述	uncharacterized SmilChr07G000104
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	560464 - 565157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991299`
GeneID	`130991299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991299`
原始查询	`LOC130991299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837874]; symbol=AT1G13160; hit=AT1G13160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837874]; symbol=AT1G13160; hit=AT1G13160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G13160` (AT1G13160) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837874] identity=55; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0630000` - identity=60.2; qcov=0.724; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000055 (ribosomal large subunit export from nucleus); GO:0005730 (nucleolus); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF05285 (SDA1_dom); PF08158 (SDA1_HEAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771414.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057771414.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057771414.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771414.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:560807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C12
`Chr7:561405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B35,C31
`Chr7:561423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B131,B68,B87,C48
`Chr7:561590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:561622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:561776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B99,C31
`Chr7:561854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:561890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:561910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr7:562072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A16,B126
`Chr7:563325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:564155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B121,B98,C74,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771414.1

794 aa

397

794

SDA1_HEAT

SDA1_dom

PF08158 SDA1_HEAT 83-458 aa PF05285 SDA1_dom 583-728 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771414.1`	Pfam	`PF08158`	SDA1_HEAT	Repeat	83	458	4e-132	441.3	SDA1, HEAT repeat
`XP_057771414.1`	Pfam	`PF05285`	SDA1_dom	Domain	583	728	1.8e-07	32.5	SDA1, conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915431.1
ACAACAAAAACAGAACCCTCAACTCTAACCGCAGCTGCCGCAGCTGCTTCTTCTTCTTCACTTCTACTTCTCGGCCATGGCGGCGCCACCGGCCAATGAGATATCTGCGTCGGGACGGACCTCAGAAAAGTTCAACCTCACATCACTGCAATCCATGATGAAAGTTGACCCCGAAGGATATGGTTCCGAGCTGTTGCTTGTTTACGATCAATTTAAATCGTCTCTCGACCTATTTCAGCAGCAATCGGCGTTGAATTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991299
ATGGCGGCGCCACCGGCCAATGAGATATCTGCGTCGGGACGGACCTCAGAAAAGTTCAACCTCACATCACTGCAATCCATGATGAAAGTTGACCCCGAAGGATATGGTTCCGAGCTGTTGCTTGTTTACGATCAATTTAAATCGTCTCTCGACCTATTTCAGCAGCAATCGGCGTTGAATTACACTTCTATTAGTGGAATCTCCGTCGACTCGTCCGTCGCCAAGGACTTGGGCGACCGGGCAATGTTTTTGGCTCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771414.1
MAAPPANEISASGRTSEKFNLTSLQSMMKVDPEGYGSELLLVYDQFKSSLDLFQQQSALNYTSISGISVDSSVAKDLGDRAMFLAHVTPFYPKELAQFPAELVRFLEASARSLLSGLRVQVTQALILLMNRKIIDIAETLEVFMVLQTLGDKVLQQLAFSHVIQSIRRMNQKHKNDPKNKALQNILFGMLQQEDEAKAKRALITLCDLHRRKVWADDRTANAICMACFHPSTRIMIAALSFLLDFEKIEDDDSDDSDSED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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