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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000106`

染色体: Chr07 坐标: 581422-585527 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000106`
名称	SmilChr07G000106
描述	protein transport protein SEC23 G
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	581422 - 585527 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991301`
GeneID	`130991301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991301`
原始查询	`LOC130991301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein SEC23 G
产物	protein transport protein SEC23 G
Arabidopsis	`AT5G43670` (AT5G43670) Sec23/Sec24 protein transport family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834387] identity=62.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0742800` (OJ1365_D05.6) - identity=58.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030127 (COPII vesicle coat); GO:0070971 (endoplasmic reticulum exit site); GO:0090110 (COPII-coated vesicle cargo loading); GO:0090114 (COPII-coated vesicle budding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00626 (Gelsolin); PF04810 (zf-Sec23_Sec24); PF04811 (Sec23_trunk); PF04815 (Sec23_helical); PF08033 (Sec23_BS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771415.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057771415.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771415.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057771415.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:581945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A20,B118,B136,B138,B17,B25,B28,B48,B61,B66,B71,B78,B79,B90,B92,B93,C18,C21,C30,C32,C33,C37,C46,C68,C71,C82,D2,D8
`Chr7:581973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:582157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:582384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:582424`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A20,B118,B136,B138,B17,B25,B28,B48,B61,B66,B71,B78,B79,B90,B92,B93,C18,C21,C30,C33,C37,C42,C46,C68,C82,D8
`Chr7:582457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B102,C19,C64
`Chr7:582781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B46,B7,C29,C4
`Chr7:582945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:583049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C21,C70,C86
`Chr7:584571`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A20,B118,B136,B138,B25,B61,B66,B79,B90,B92,B93,C18,C21,C30,C32,C33,C37,C42,C46,C68,C71,C82,D8
`Chr7:584581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B87,C48
`Chr7:584649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771415.1

790 aa

395

790

zf-Sec23_Sec24

Sec23_trunk

Sec23_BS

Sec23_helical

Gelsolin

PF04810 zf-Sec23_Sec24 53-91 aa PF04811 Sec23_trunk 169-423 aa PF08033 Sec23_BS 435-536 aa PF04815 Sec23_helical 548-646 aa PF00626 Gelsolin 662-748 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771415.1`	Pfam	`PF04810`	zf-Sec23_Sec24	Domain	53	91	1.3e-11	45.0	Sec23/Sec24 zinc finger
`XP_057771415.1`	Pfam	`PF04811`	Sec23_trunk	Domain	169	423	3.8e-48	164.9	Sec23/Sec24 trunk domain
`XP_057771415.1`	Pfam	`PF08033`	Sec23_BS	Domain	435	536	5.3e-19	69.3	Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
`XP_057771415.1`	Pfam	`PF04815`	Sec23_helical	Domain	548	646	4.8e-25	88.1	Sec23/Sec24 helical domain
`XP_057771415.1`	Pfam	`PF00626`	Gelsolin	Domain	662	748	6.9e-07	29.7	Gelsolin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915432.1
GTTCACGTGACTCGGCACGTGACTGGACTGCACTTTCCCTCACTTCTGCACTTTCCCTCTCCGGTCGAAAGCCGGCCATCACTTTTTCAATTTTCAAATTTTCAACTATAAAATCATAAATTAAACCCTAATTTTTCACAAATTCCCCAAAATCACAAAACTGCTGGCCCCGATCCCGATTAGGGTTCATCAACTCCTGTTACCCCCGATGAAAATCCCCTAAAGCCTCCTAAATCGTCGATGGATTTCACCGAATTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991301
ATGGATTTCACCGAATTGGAAGCGATCGAGGGTTTGCGTTGGCCGTGGCACTCATGGCCGCTCTCGAAGCCCGAGGTCTCAGCTTTGGTCGTTCCACTATCGATTATGTGCACTCCGCTGATGCCGTTCAGCGAGCTGCCGATCCTAGCTCACGAGCCGGTGAACTGCTTCCAATGCGGCGCGGTTTGGAACCCCTACTCCCGCATCGATTACACCACTAAAATCTGGGTTTGTCCCTTTTGCTACCGGAGGAACCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771415.1
MDFTELEAIEGLRWPWHSWPLSKPEVSALVVPLSIMCTPLMPFSELPILAHEPVNCFQCGAVWNPYSRIDYTTKIWVCPFCYRRNPFPRSYDHINENNIPAELFPTYSTVEYHLGPAPSSGLGLGMDSGLGRTASGPLRSNSGSFSNVSAAYSGTGEWSGVSGGVGVGPAFVFVVDGCSSEEDLGALKGELLHIIARLPENALVGLVVFDAMVRVYDLGFTDCLRAVVFHGGREVSSEKAKELLGLHHMKQSIGKTSSVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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