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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000117`

染色体: Chr07 坐标: 648617-654539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000117`
名称	SmilChr07G000117
描述	pyruvate kinase isozyme A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	648617 - 654539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991310`
GeneID	`130991310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991310`
原始查询	`LOC130991310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyruvate kinase isozyme A, chloroplastic
产物	pyruvate kinase isozyme A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G22960` (PKP-ALPHA) Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821870] identity=78.3; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0181000` (OsPKpa1) - identity=85.1; qcov=0.878; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00224 (PK); PF02887 (PK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771424.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057771424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:648867`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr7:648867`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr7:648896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D8
`Chr7:648911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr7:648938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C8
`Chr7:649007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B26,C11,C69,C82
`Chr7:649011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:649062`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr7:649062`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr7:649177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B1,B127,B30
`Chr7:649222`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr7:649222`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771424.1

572 aa

286

572

PK_C

PF00224 PK 93-424 aa PF02887 PK_C 463-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771424.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	93	424	1.6e-90	304.2	Pyruvate kinase, barrel domain
`XP_057771424.1`	Pfam	`PF02887`	PK_C	Domain	463	562	1.6e-25	90.1	Pyruvate kinase, alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915441.1
AAAAGAAATAAATATGCAGAAATGGAATATTCGTGTGAGAAATAAATCGCCATATCCAACGAGATTTCCTAAGTGAGTCTTCTTCTAACTTCGCTTTCTCCGCCTTCTTCCTTTATTACATCAAAATTCTTCATCCAGCTCAACTCCTCTCTTCTCTCTCCGCCATCTTTCAACGGCGGCGCTCTGCTTCTAGGAGAATTTGCAGCAATTCAATCGGTCGGCAATGGCGCAGGCACTGAATTTCTTCATTTCCACCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991310
ATGGCGCAGGCACTGAATTTCTTCATTTCCACCTCACATTCCGCCAAACCCCTAATCCCCCACCGCTCGCAGCAATTTTCTCACTCCATTTCTCGCCTCGCCCTCGTCAAAAACCCTAGAAAAACCTCGCTGTTCATCAGAGCATCTGCGTCCGACAACGGCGCGGGCACCGGCGTGCAGGACCACGTCTCCCTCGCCGCGGCCGCCGATTCCAGCTCGATCGAGGTGGATGCGGTGACGGAGGCGGAGCTCAAGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771424.1
MAQALNFFISTSHSAKPLIPHRSQQFSHSISRLALVKNPRKTSLFIRASASDNGAGTGVQDHVSLAAAADSSSIEVDAVTEAELKENGFRSTRRTKLICTIGPATCKPEQLEALAVGGMNVARINMCHGTREWHREVIQRVRRLNEEKGYAVAIMMDTEGSEIHMGDLGGASSAKAEDGEIWTFSVRAFDSGLPEHTIIVNYGGFAEDVNIGDELLVDGGMVRFEVIEKIGPDVKCRCTDPGLLLPRANLTFWRDGSLVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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