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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000140`

染色体: Chr07 坐标: 836691-838754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000140`
名称	SmilChr07G000140
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	836691 - 838754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991330`
GeneID	`130991330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991330`
原始查询	`LOC130991330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT5G56420` (AT5G56420) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743] identity=24.3; qcov=0.996; evalue=4.35e-22; confidence=weak
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=26; qcov=0.578; evalue=1.33e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771451.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771451.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771451.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771451.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:836985`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B137,D6
`Chr7:836985`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B137,D6
`Chr7:836998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,D6
`Chr7:837010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:837137`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr7:837137`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr7:837147`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A25,A4,B131,B139,B15,B18,B72,B83,C22,C87
`Chr7:837150`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A25,A4,B131,B139,B15,B18,B72,B83,C22,C87
`Chr7:837158`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A25,B131,B139,B15,B18,B72,B83,C22,C87
`Chr7:837198`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A25,B131,B139,B15,B18,B83,C22,C87
`Chr7:837201`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr7:837201`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771451.1

479 aa

240

479

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 14-50 aa PF24758 LRR_At5g56370 108-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771451.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	14	50	0.00015	22.3	F-box domain
`XP_057771451.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	108	227	4.8e-09	36.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915468.1
GTGTGTTTGTTCATCAGCTCAAACAAGGGTTTTGCTGGCGCGAGAATGAAGACGCGTTCATCTTCAGAGGTTTTGATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGTTAATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAACGGTGGAATAACCTTTGGACCACCACTCCCTACCTTAATTTCGACATTTATGCTATGGAGTTTAATTGTGCTAGAGAGCTTCGAAACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991330
ATGAAGACGCGTTCATCTTCAGAGGTTTTGATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGTTAATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAACGGTGGAATAACCTTTGGACCACCACTCCCTACCTTAATTTCGACATTTATGCTATGGAGTTTAATTGTGCTAGAGAGCTTCGAAACTTCATTAATCGGGTCTTAGTAAGCTGGAATGGGGTAAGGGTTCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771451.1
MKTRSSSEVLMDRLSELPDSLIFHIFWLLPMTDVVRTTILSKRWNNLWTTTPYLNFDIYAMEFNCARELRNFINRVLVSWNGVRVLKFKVVLYCELDSLDDSFEADTDLWVHFAKHNQAEELYFHANLSIYDYTIVKDWMPQCLYSCSSLKVLSITNGYFRIKGNVQWNQLKSLAISITDLGLITEDVINQILCGSPQLEVLIMSFGERGKSMSIRSTSLKELSIYKYDGGVQGYASYASTSTELRIWTPNLKTLEIKGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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