当前解析结果
SmilChr07G000138| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000138 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000138 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000138 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 820621 - 822036 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991331 |
|---|---|
| GeneID | 130991331 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991331 |
| 原始查询 | LOC130991331 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991331 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771452.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771452.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771452.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771452.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057771452.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:820813 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B2,B44,C29,C41 |
Chr7:820830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C39,C85,D10 |
Chr7:820864 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr7:820868 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B119,B140,B22,B79,C31 |
Chr7:820883 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 14 | B119,B138,B14,B140,B15,B22,B29,B35,B47,B62,B79,C31,C46,C54 |
Chr7:820888 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 14 | B119,B138,B14,B140,B15,B22,B29,B35,B47,B62,B79,C31,C46,C54 |
Chr7:820941 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B26,B42,B43 |
Chr7:820941 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B26,B42,B43 |
Chr7:821078 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 54 | A23,A25,A7,B1,B10,B100,B102,B104,B105,B107,B11,B112,B119,B126,B14,B17,B30,B32,B34,B41,B5,B54,B58,B78,B79,B98,C11,C12,C18,C19,C23,C25,C28,C3,C30,C31,C36,C39,C46,C50,C53,C55,C56,C60,C69,C72,C76,C79,C8,C84,C86,C9,D5,D7 |
Chr7:821169 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B125,B40,B63,C29,C63,C78 |
Chr7:821171 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B125,B40,B63,C29,C63,C78 |
Chr7:821176 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B125,B40,B63,C29,C63,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。