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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000139`

染色体: Chr07 坐标: 831120-833805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000139`
名称	SmilChr07G000139
描述	ylmG homolog protein 1-2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	831120 - 833805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991332`
GeneID	`130991332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991332`
原始查询	`LOC130991332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ylmG homolog protein 1-2, chloroplastic-like
产物	ylmG homolog protein 1-2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G27990` (YLMG1-2) YGGT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828912] identity=75; qcov=0.492; evalue=7.91e-59; confidence=medium
Rice	`Os07g0185300` - identity=45; qcov=0.41; evalue=6.26e-24; confidence=low
GO	GO:0010020 (chloroplast fission); GO:0016020 (membrane); GO:0090143 (GO:0090143)
KEGG	-
Pfam	PF02325 (CCB3_YggT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771453.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057771453.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057771453.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057771453.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:832832`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B48,B49,B53,B71,B82,C53,D1,D2
`Chr7:832883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr7:832924`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A14,B22,B43,B58,B62,C21,C32,C41,C48,C68,C73
`Chr7:832964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr7:832975`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,B98
`Chr7:832975`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A18,B98
`Chr7:832995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B136,B26
`Chr7:833011`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A14,B22,B27,B42,B43,B51,B58,B62,B7,B79,C21,C25,C32,C41,C48,C68,C73
`Chr7:833015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B78,B90,B92,D6
`Chr7:833018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A16,B119,B121,B136,B24,B26,B27,B31,B5,B64,B84,C16,C20,C42,C52,C59
`Chr7:833029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B105,B136,B26,B71
`Chr7:833052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B81,C23,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771453.1

244 aa

122

244

CCB3_YggT

PF02325 CCB3_YggT 166-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771453.1`	Pfam	`PF02325`	CCB3_YggT	Domain	166	237	1.3e-16	61.4	CCB3/YggT

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915470.1
CTCTCGTAAGCCTACTCCGCCCCCAGTCCGCCTCGCTGCTTCCCCGGTCTGGCGCGCCTCCGGCAGCCTCCTCCCATCAGATCCTCCACCCGCCCTCCTTCTCTTCTCCGGCGTCGTTGGCCGCCGTGCCTGGATCCAGCGAAGTCGTACCTCCATTTCTCCTCATATCTCAACATATTCTCACCTCTCTCCTTCGCATCCCTCAATTTCACAGTTCGTGCCCTAGATCTTCTTCCAAAATGTTATCACCTCAAGGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991332
ATGTTATCACCTCAAGGATCTCCGCCGCGATTAGCTCCGGCGACGCTGGATGCCGCCGCCTCTGAAATTGGCGAGGCAGTCGCCGTCCTCTGTTCTCACCTACTCATTCACACACACACGGCCACCTTATCCCACCCAGCGCCTTCCCTCTCCCTTCATCCCACTCTCACCTCTACCCCACCACCTCAAAACCCAATTTCCTTCCCCTTTTCCCCTCCCCAAACCCTTCAATTCCGGAATCTCCGCCTCCATTTCCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771453.1
MLSPQGSPPRLAPATLDAAASEIGEAVAVLCSHLLIHTHTATLSHPAPSLSLHPTLTSTPPPQNPISFPFSPPQTLQFRNLRLHFRPRYSQTGSGNSDRVNPDSHLLVALGLTASKFFAHRLLNLAVQLKEPLLCSAGPTFFAAAKDVPTVSLNTPFTVVAAGMAKWLDLYSGVLMVRVLLSWFPNIPWDCQPLSTIRDLCDPYLNLFRNIIPPIFDTLDVSPLLAFTVLGTLGSILNSSRQSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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