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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003250`

染色体: Chr01 坐标: 51219556-51221377 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003250`
名称	SmilChr01G003250
描述	transcription factor MYB26-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51219556 - 51221377 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991333`
GeneID	`130991333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991333`
原始查询	`LOC130991333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB26-like
产物	transcription factor MYB26-like
Arabidopsis	`AT3G13890` (MYB26) myb domain protein 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820602] identity=89.8; qcov=0.377; evalue=2.25e-77; confidence=low
Rice	`Os01g0709000` - identity=85.7; qcov=0.38; evalue=4.34e-76; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771458.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771458.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771458.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771458.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51219823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:51220448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C42
`Chr1:51220645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B56
`Chr1:51220683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr1:51220688`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A2,A21,B121,B124,B35,B38,B39,B45,B65,B76,B98,C16,C27,C28,C31,C39,C45
`Chr1:51220692`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A2,A21,B124,B35,B38,B39,B45,B65,B76,B98,C16,C27,C28,C31,C39,C45
`Chr1:51220693`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr1:51220693`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr1:51220699`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B124,B39
`Chr1:51220699`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B124,B39
`Chr1:51220764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B55
`Chr1:51220773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771458.1

313 aa

156

313

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-110 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771458.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	2.2e-37	127.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771458.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	75	7.7e-23	81.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771458.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	110	2.2e-37	127.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057771458.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	116	7.7e-23	81.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915475.1
CTCTCAGATACTATACATTTCTCTCCAATAATATTCCCTCTGCACACCAACCCTCCTCTCTCTCTCTTATATACTCCATATATATATATAAAGCCTGCAGTCTGTCATCAGCTGCGATTCGGAGAAATTAAGGATATATATATATATTAAAGAAATGTCGCATCACAGCTGCTGCAACAAACAGAAAGTGAAGAGGGGGCTGTGGTCTCCCGAGGAAGATGAGAAACTCATCAACTACATCTCCACCTACGGCCATGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991333
ATGTCGCATCACAGCTGCTGCAACAAACAGAAAGTGAAGAGGGGGCTGTGGTCTCCCGAGGAAGATGAGAAACTCATCAACTACATCTCCACCTACGGCCATGGCTGCTGGAGCACTGTCCCAAGACTCGCAGGATTACAAAGATGTGGCAAAAGCTGCAGGCTGAGATGGATCAATTACCTACGCCCTGATCTCAAGAGAGGCAATTTCACCCCACAAGAAGCTGCCCTCATCATCGAGCTCCACAGACTCTTGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771458.1
MSHHSCCNKQKVKRGLWSPEEDEKLINYISTYGHGCWSTVPRLAGLQRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNFTPQEAALIIELHRLLGNRWAQIAKHLPGRTDNEVKNFWNSSIKKKIMAHHNMSSSALISSSNLQHPNLIIPNHPQIDQIIIPNSQMEQLGFQIDPNLTTYAPNLALIHHTSAHNNSLDSSVSDLQSWSSQALKQDNGAVLGYDGGYDQDSALLDALMPELAEMAKGLEFGVSANAAAASQIEDGLDSGFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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