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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000156`

染色体: Chr07 坐标: 926021-928577 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000156`
名称	SmilChr07G000156
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	926021 - 928577 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991339`
GeneID	`130991339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991339`
原始查询	`LOC130991339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT1G13780` (AT1G13780) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837938] identity=27; qcov=1; evalue=2.97e-23; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=27; qcov=0.782; evalue=4.99e-15; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771472.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771472.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771472.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771472.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:926285`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A6,B1,B118,B27,B54,B59,B72,C1,C34,C49,C65,C72,C80,D1,D11
`Chr7:926329`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	82	A1,A14,A16,A2,A20,A21,A22,A25,A8,B100,B102,B103,B104,B110,B111,B122,B124,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B17,B24,B3,B36,B4,B40,B47,B52,B53,B56,B6,B65,B7,B70,B76,B77,B80,B81,B83,B90,B92,B93,B94,B96,C13,C15,C18,C21,C22,C26,C27,C30,C32,C33,C36,C38,C39,C55,C56,C64,C66,C67,C68,C71,C72,C74,C76,C79,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D11,D3,D4,D5,D6
`Chr7:926369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C33,C46
`Chr7:926381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D7
`Chr7:926429`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B72,C34,C65
`Chr7:926429`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B72,C34,C65
`Chr7:926433`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B72,C34,C65
`Chr7:926433`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B72,C34,C65
`Chr7:926481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:926502`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A10,B103,B20,C10,C16,C39
`Chr7:926520`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B60,B72,B80
`Chr7:926520`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B60,B72,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771472.1

478 aa

239

478

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-40 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 71-253 aa PF24758 LRR_At5g56370 95-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771472.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	40	8.5e-05	23.0	F-box domain
`XP_057771472.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	71	253	4.3e-11	43.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771472.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	95	240	1.5e-16	61.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915489.1
ATAATTTATTGTAAACTAAAACCCTTATAAAAGAATTTTCGGAAAAGAATACAGACCATCATCAATTTTCTCCGATAATTATCTTTTATTTCGAAGATTTGCCATTTTATCTGCTGTCCAAGTTCCAAGGCTTAATTTTCCACTTCAATTTTAGCTCAAACAAGGGTTTTGTTGGCTCGAGCCTCGAGAACGAAGAAGCGTTCATCTTGAGAGGTTTTCATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991339
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTCGTTGCCTATGACCGATGTTGTTGGGACAACGTTTCTGTCGAAGCGCTGGAAAAACCTTTGGACCACCGCACCCTACCTTAATTTCGACAATGATGCTATGGGGTTTGATGATGATACAAAGCTTCAAAACTTCGTTAATCGGGCCTTATTGCGCTGGAATGGGGTAAGGCTTCTGAAATTCAAGTTCAAATCGGCTTATGAGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771472.1
MDRLSELPDSIIFHIFWSLPMTDVVGTTFLSKRWKNLWTTAPYLNFDNDAMGFDDDTKLQNFVNRALLRWNGVRLLKFKFKSAYEFDESMCLGTDLWLQFAKDKEVEELYLHIRYIINDNDDIYWMPQGVYSCSSLKVLSFTGCNLRVYGNVQWNQLKSLTIINGFGVTEHVINQILCGSPRLEVLILSFADRGENLCIRSTSLKVLSIFKFYDWSKDLCWDSELRICTPNLETLKIQGATYKKCLLVNVSSLTHATLAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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