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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000154`

染色体: Chr07 坐标: 907677-937351 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000154`
名称	SmilChr07G000154
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	907677 - 937351 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991342`
GeneID	`130991342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991342`
原始查询	`LOC130991342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771480.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771480.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771480.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771480.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:907994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:908065`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B10,B127,B41,B63,C10,C45,C50,C51,C59
`Chr7:908089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:908110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C23
`Chr7:908126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C23
`Chr7:908152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B130,B62
`Chr7:908154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B130,B62
`Chr7:908159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C33,C46
`Chr7:908180`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr7:908180`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr7:908191`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A13,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A3,A4,A5,B101,B102,B107,B112,B115,B119,B122,B126,B136,B139,B140,B25,B28,B32,B34,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B46,B52,B53,B69,B7,B71,B75,B77,B79,B81,B87,C1,C14,C19,C20,C21,C22,C27,C31,C38,C39,C40,C47,C53,C57,C58,C6,C65,C70,C71,C79,C8,C87,C9,D2,D9
`Chr7:908220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771480.1

471 aa

236

471

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 93-241 aa

XP_057771481.1

468 aa

234

468

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 93-241 aa

XP_057771482.1

459 aa

230

459

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-43 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 74-425 aa PF24758 LRR_At5g56370 93-215 aa

XP_057771483.1

338 aa

169

338

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-43 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 74-266 aa PF24758 LRR_At5g56370 93-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771480.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	93	241	9.9e-13	49.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057771481.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	93	241	5e-11	43.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057771482.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	43	0.00039	20.9	F-box domain
`XP_057771482.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	74	425	1.4e-08	35.2	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771482.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	93	215	1.6e-11	45.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057771483.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	43	0.0003	21.3	F-box domain
`XP_057771483.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	74	266	2e-09	38.0	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771483.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	93	215	4e-12	47.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915498.1
GAGCTACTACTGCCTTGGTAGTTGTGGAAATGGTGGGTCCCACTTGAAATACACATAAACCCTCTGTATCTCCAATTCCCAACCCTCCGCCGCCATTGTCAATTGATTTTTTTCAGATTCACCGACTCCGCCGCCGCCTCTGTCGCTTCTAGTCGCGGCCACCATGGATCCTTTCGCCCCTTACTTGTTGGCGCTTGCTCCGTCTCGATCCCCTCGTTGAACAAGCTCTTTCTCTAGCTCGGCTCAAATTGTTGATTAGC...

XM_057915500.1
ATCTCCATCTCCAATTCCGAACCCGCCGCCGCTCAGTCGTCAGCGTCTCTCTCACCACCGCAGCACCCCACCCCCACACCGGCCGAAATCAATCCCGCCACCATTCAATTCATCTTCTCTACTTTCCGCCGCCATTATCAACCTGCCACCCCATCAGCTGAACTAAAAGCACATCATTTTGCCGATTGATTTTTTCAAATTCACCGACTCCGCCGCCACATCTGTCGCTTCTAGTCGCGGCCTCCATGGATCCTTTCGCC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130991342
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCCGACTCTGTTATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATGTGGGAAGTTGTTAGGACAACAATTCTGTCAAAGCGCTGGTTAAACCTCTGGACCATCACCCCTTTCCTTAATTTTGATGAAACTGATTCGAGTTTTGATACTACAGAACAATTTCGAAACTCCGTGCAGCGGCCTTTATTACGCTGGGATGGGGTAAAGGTTCTGAAATTCAAGGTTGATACTGGTGAAAATAAATC...

LOC130991342
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCCGACTCTGTTATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATGAATGAAGTTGTTAGGACAACAATTCTGTCAAAGCGCTGGTTAAACCTCTGGACCACCACCCCTTTCCTTAATTTTGATGAATCTAAATCTGATTCACAATTTAGTACTACAGATAAATTTCGACACTTCGTTCACCAGGCTTTATTATGCTGGGATGGGGTAAAGGTTCTGAAATTAAAGGTTGTTGCGAATTATGA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057771480.1
MDRLSELPDSVIFHIFWLLPMWEVVRTTILSKRWLNLWTITPFLNFDETDSSFDTTEQFRNSVQRPLLRWDGVKVLKFKVDTGENKSINGDVDLWVRFAKKYEVEELYLHRVIDEIFWADDGEHNVYWVPQYLYSCSSLKVLSITNCYFRIKGNVQWNHLKSLTIVDGFGVTEHVINQILCGSPRLEVLIMSLLECGKSLVIRSASLKELLIYRYLDSYSDESYSTAELRIWTPNLERLDVKGLPYRKCLFMNVSSLIHA...

XP_057771481.1
MDRLSELPDSVIFHIFWLLPMWEVVRTTILSKRWLNLWTITPFLNFDETDSSFDTTEQFRNSVQRPLLRWDGVKVLKFKVDTGENKSINGDVDLWVRFAKKYEVEELYLHRVIDEIFWADDGEHNVYWVPQYLYSCSSLKVLSITNCYFRIKGNVQWNHLKSLTIVDGFGVTEHVINQILCGSPRLEVLIMSLLECGKSLVIRSASLKELLIYRYLDSYSDESYSTAELRIWTPNLERLDVKGLPYRKCLFMNVSSLIHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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