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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003255`

染色体: Chr01 坐标: 51256189-51261192 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003255`
名称	SmilChr01G003255
描述	putative hydrolase C777.06c
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51256189 - 51261192 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991374`
GeneID	`130991374`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991374`
原始查询	`LOC130991374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative hydrolase C777.06c
产物	putative hydrolase C777.06c
Arabidopsis	`AT3G13800` (AT3G13800) Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820592] identity=75.8; qcov=0.885; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0363800` - identity=81; qcov=0.803; evalue=3.46e-177; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00753 (Lactamase_B); PF12706 (Lactamase_B_2); PF23023 (Anti-Pycsar_Apyc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991374

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771537.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057771537.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057771537.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771537.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51256403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D4
`Chr1:51257554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:51257590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:51258981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:51260137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B60,B66,B98,C48
`Chr1:51260682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:51260871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,B46,B51
`Chr1:51260935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B74,C45,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771537.1

355 aa

178

355

Lactamase_B

Anti-Pycsar_Apyc1

Lactamase_B_2

PF00753 Lactamase_B 118-187 aa PF23023 Anti-Pycsar_Apyc1 128-284 aa PF12706 Lactamase_B_2 131-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771537.1`	Pfam	`PF00753`	Lactamase_B	Domain	118	187	1.3e-07	32.5	Metallo-beta-lactamase superfamily
`XP_057771537.1`	Pfam	`PF23023`	Anti-Pycsar_Apyc1	Family	128	284	2.7e-07	31.3	Anti-Pycsar protein Apyc1
`XP_057771537.1`	Pfam	`PF12706`	Lactamase_B_2	Domain	131	317	8.9e-24	84.9	Beta-lactamase superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915554.1
ACGAATCTGAAAATAATTCGCTCATGTCTCTCCTGTCGTCTCCTCCACAGCGTAGGCACAATAAACTGCATTTCATTCTGTATCTAAGGAATAACAAAACAAAAGGAAATGTTTGTACCTCTCGCCTTTGGAATTGTACGCCCTCTCTATGCTCCATGGCTCCGTGGAACCCGATCCATGAACCTGTTTTCCCTCTCTATGAAGGGACCATTTTCCGTTTCAGTAAACGTGTCGTCTCGCTTCAGCCCCATCGTCCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991374
ATGTTTGTACCTCTCGCCTTTGGAATTGTACGCCCTCTCTATGCTCCATGGCTCCGTGGAACCCGATCCATGAACCTGTTTTCCCTCTCTATGAAGGGACCATTTTCCGTTTCAGTAAACGTGTCGTCTCGCTTCAGCCCCATCGTCCAAGCTTCGCTTCATTCCAGTTCTCTACCTGATTCTGATCGAGCGCAGGTTTCGCCTTCGGTTGAACAATCTGAGATCATTTTTATCGGGACTGGAACTAGTGAAGGGATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771537.1
MFVPLAFGIVRPLYAPWLRGTRSMNLFSLSMKGPFSVSVNVSSRFSPIVQASLHSSSLPDSDRAQVSPSVEQSEIIFIGTGTSEGIPRVSCLTNPIKTCPVCSKATEPGSKNRRLNTSLLVRYLNPSGKWNILIDAGKFFYHSALRWFPAYGIRTIDAVIITHSHADAIGGMDDLRDWTNNVQPSIPIYTAKRDFEVMKKTHYYLVDKSGVTPGAAVSTLQFNIIQEEPFAVCDLEFTPLPVWHGRGYRSLGFRFGNICY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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