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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000184`

染色体: Chr07 坐标: 1169473-1171740 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000184`
名称	SmilChr07G000184
描述	stem-specific protein TSJT1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1169473 - 1171740 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991376`
GeneID	`130991376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991376`
原始查询	`LOC130991376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stem-specific protein TSJT1
产物	stem-specific protein TSJT1
Arabidopsis	`AT3G22850` (AT3G22850) aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821857] identity=73.2; qcov=1; evalue=7.8e-135; confidence=high
Rice	`Os03g0744600` - identity=58.3; qcov=1.01; evalue=1.82e-108; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12481 (DUF3700); PF13522 (GATase_6); PF13537 (GATase_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771536.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771536.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771536.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771536.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1169725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B86
`Chr7:1169761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B86
`Chr7:1169769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:1169775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C11,C69
`Chr7:1170360`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr7:1170400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C53
`Chr7:1170490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:1170500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C45
`Chr7:1171595`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B130,B7,C33,C41,C46,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771536.1

250 aa

125

250

DUF3700

GATase_7

GATase_6

PF12481 DUF3700 2-226 aa PF13537 GATase_7 75-172 aa PF13522 GATase_6 76-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771536.1`	Pfam	`PF12481`	DUF3700	Domain	2	226	4.5e-105	350.9	Aluminium induced protein
`XP_057771536.1`	Pfam	`PF13537`	GATase_7	Domain	75	172	1.1e-08	35.9	Glutamine amidotransferase domain
`XP_057771536.1`	Pfam	`PF13522`	GATase_6	Domain	76	177	1.4e-07	31.8	Glutamine amidotransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915553.1
ACAGAACTTCAATTCATCAACTGATCCACAGCTGAAATCTATAAAAGTCAATAATAGAGTCATCATCACCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACATTTTCCTCTGAGATTTTCTTCAGTCGATCAAGAAAAAAAAAGCGAAAATGCTGGCCGTCTTCAACAAATCGGTGGCGAAAAGCCCAGATGCACTGCAGCAGAGCCCCGTAAACGGCGCCGTTTCCGCCCTAAAAGACGGATTCTTGGCGGCGCATTTCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991376
ATGCTGGCCGTCTTCAACAAATCGGTGGCGAAAAGCCCAGATGCACTGCAGCAGAGCCCCGTAAACGGCGCCGTTTCCGCCCTAAAAGACGGATTCTTGGCGGCGCATTTCTCCTCCGCACACTCGGGCTCCTTCGTAATCAATCTCGCCTCTTCCGGCTTCATTGCCTACTCTTCTTCCCGACAGAACCCTCTTCTTCCTAGACTTTTTGCGGTTGTGGATGATATGTTCTGCTTGTTCGAGGGCCACATTGAAAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771536.1
MLAVFNKSVAKSPDALQQSPVNGAVSALKDGFLAAHFSSAHSGSFVINLASSGFIAYSSSRQNPLLPRLFAVVDDMFCLFEGHIENIAALKQQYGLNKTANEVSIVIEAYRTLRDRGPYPAEQVVRGIHGRFAFILFDATSQSTFIASDVDGSVPFFWGTDAEGHLVVSTDTEIVKQGCGKSFSPFPKGCFFTSSGGLRSYEHPNELKAVPRVDSSGEVCGMTFKVDEESRKEKPAMPRVGSDANWSKHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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