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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000209`

染色体: Chr07 坐标: 1329631-1332931 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000209`
名称	SmilChr07G000209
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1329631 - 1332931 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991389`
GeneID	`130991389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991389`
原始查询	`LOC130991389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G10920` (LOV1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837635] identity=28.7; qcov=0.83; evalue=1.19e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.4; qcov=0.956; evalue=7.9e-78; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771557.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771557.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771557.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771557.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1330252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:1330254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:1330255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B31,B43,C49,C76
`Chr7:1330261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr7:1330268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B76,C40,C9
`Chr7:1330280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B62,C22,C86
`Chr7:1330292`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B101,B118,B120,B132,B23,B61,B90,C16,C35,C43,D5
`Chr7:1330298`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B101,B118,B120,B132,B23,B61,B90,C16,C35,C43,D5
`Chr7:1330306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C86
`Chr7:1330323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C35,D8
`Chr7:1330345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B30,C15,D2
`Chr7:1330356`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A1,A16,A22,A8,B101,B115,B130,B15,B27,B50,B61,B70,B82,B91,B95,C1,C41,C50,C55,C57,C59,C63,C80,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771557.1

878 aa

439

878

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 165-332 aa PF23559 WHD_DRP 415-485 aa PF23598 LRR_14 565-860 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771557.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	165	332	6.4e-43	147.0	NB-ARC domain
`XP_057771557.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	415	485	6.8e-20	71.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057771557.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	565	860	2.2e-14	53.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915574.1
CAAAGATGGCCTTAATAATGGCAGCCATATTTACTGAACACCACTTTCCTTTCCTTTTGTTTTGTTTTGCTTATTTTTCGAGTGAGCAGAGATCTGAAAAATGGCTTACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTCCAAGGGATTCTGGATCCCCAACAAACACACTGGATTCTTGGACAAGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTTCTTACCTACAGCAGAAGATTCTCGAAAAAACTCCACCACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991389
ATGGCTTACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTCCAAGGGATTCTGGATCCCCAACAAACACACTGGATTCTTGGACAAGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTTCTTACCTACAGCAGAAGATTCTCGAAAAAACTCCACCACTCACCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGACATCGTTGAATCTCACATGGTTAGACGAATTTTCTCGATGCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771557.1
MAYNLQSLITILQGILDPQQTHWILGQEKPQLQSLLQKASYLQQKILEKTPPLTKIPSLECQIRDVANEAEDIVESHMVRRIFSMHESYMLEQLFSMPEEEEEEEEEEEDATPDVLLVTQKLDSLTQQVEELVEVETNKKPTGSSWSGASFSSSKSVVVGVDEVLMQLKDRLTGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARKLYQDPLILDHFNYLAWTTISQDYNMRSILLSLLRCITGSDYEHKGDGELKDILYRSLYGRRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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