当前解析结果
SmilChr07G000195| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000195 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000195 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000195 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 1228404 - 1229768 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991401 |
|---|---|
| GeneID | 130991401 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991401 |
| 原始查询 | LOC130991401 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991401 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771589.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057771589.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057771589.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771589.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771589.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:1228719 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,B98,C29 |
Chr7:1228727 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr7:1228771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | C24,C4,C81 |
Chr7:1228771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C24,C4,C81 |
Chr7:1228776 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr7:1228786 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B28 |
Chr7:1228788 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B86 |
Chr7:1228792 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 22 | A5,A7,B1,B109,B122,B138,B25,B28,B29,B48,B50,B96,C10,C36,C45,C59,C63,C78,C82,C86,D10,D4 |
Chr7:1228801 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B16 |
Chr7:1228801 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr7:1228848 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,B18 |
Chr7:1228850 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B18,B70,C28 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。