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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000216`

染色体: Chr07 坐标: 1390246-1394670 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000216`
名称	SmilChr07G000216
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1390246 - 1394670 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991414`
GeneID	`130991414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991414`
原始查询	`LOC130991414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G58520` (AT3G58520) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825021] identity=65.5; qcov=0.856; evalue=4.07e-180; confidence=high
Rice	`Os04g0546100` - identity=51.4; qcov=0.933; evalue=3.33e-120; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771614.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771614.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771614.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771614.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1390447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C11,C69
`Chr7:1390556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:1390580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:1390582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B74,C4
`Chr7:1390614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr7:1390647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B15,B30,C25
`Chr7:1390656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:1390685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C11,C69
`Chr7:1390729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B46
`Chr7:1391524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B109,B38,B39
`Chr7:1391535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B29,C47
`Chr7:1391656`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A3,A4,A6,A7,A8,B1,B100,B102,B106,B107,B108,B11,B113,B114,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B140,B17,B18,B2,B21,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B40,B44,B48,B49,B51,B52,B57,B6,B60,B62,B63,B65,B68,B69,B7,B72,B75,B77,B81,B82,B84,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C17,C20,C24,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C6,C60,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C73,C75,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D3,D5,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771614.1

417 aa

208

417

PORR

PF11955 PORR 35-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771614.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	35	368	1.4e-116	389.7	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091148.1
AATTAAATAAAATAGGTTAAAATTCGAAGCCGCCTCCTTCCATGCTCAGCTGATTGCTCAGTTTCTCTGCTTCAAATCTCTCTCTCATAACATAACTGTCGTCTATTTCTGATGATTTGATCAGATTCGCGATGAATTTCAACTCCAAGTATAAATCTCTGGCTTCATTATTGAAATTCCCGCTCCACAATCTCCAGCATCGCCGCACAATCGCCAAAGTTCGTCTCAAATGGGTGAAAAACCGGTCTTTGGATCACATC...

XM_057915631.1
AATTAAATAAAATAGGTTAAAATTCGAAGCCGCCTCCTTCCATGCTCAGCTGATTGCTCAGTTTCTCTGCTTCAAATCTCTCTCTCATAACATAACTGTCGTCTATTTCTGATGATTTGATCAGATTCGCGATGAATTTCAACTCCAAGTATAAATCTCTGGCTTCATTATTGAAATTCCCGCTCCACAATCTCCAGCATCGCCGCACAATCGCCAAAGTTCGTCTCAAATGGGTGAAAAACCGGTCTTTGGATCACATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991414
ATGAATTTCAACTCCAAGTATAAATCTCTGGCTTCATTATTGAAATTCCCGCTCCACAATCTCCAGCATCGCCGCACAATCGCCAAAGTTCGTCTCAAATGGGTGAAAAACCGGTCTTTGGATCACATCATCGACGTCCAAACCGACATCAAAGCCGCTTGTCTCATCAAAAACGCGATCATCCGCTCGCCGACGGGATATTTGACCTCCAAATCGCTCCTCGATTCTCAGAAACTGCTGGGCCTCACCGTGCCGACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771614.1
MNFNSKYKSLASLLKFPLHNLQHRRTIAKVRLKWVKNRSLDHIIDVQTDIKAACLIKNAIIRSPTGYLTSKSLLDSQKLLGLTVPTLRFMRRYPTLFEEYPHPKYPSLACFKLTELGTMMHQKELGVFEQCEADIVERLCRVLMMTRNQMLPFQSLHPLKWDLGLPDDFDRNLVRKYPDHFRVVKGSSGSNCLKLAQWREEFSVSSLQKMNEKSIIDGAPRYRGFKRGEAALEFPMSFPRGYGAQKKVKAWMEDFQKLPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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