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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000229`

染色体: Chr07 坐标: 1485890-1487849 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000229`
名称	SmilChr07G000229
描述	uncharacterized SmilChr07G000229
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1485890 - 1487849 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991426`
GeneID	`130991426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991426`
原始查询	`LOC130991426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal protein L7/L12 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843355]; symbol=AT1G70190; hit=AT1G70190; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ribosomal protein L7/L12 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843355]; symbol=AT1G70190; hit=AT1G70190; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G70190` (AT1G70190) ribosomal protein L7/L12 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843355] identity=53.9; qcov=1.02; evalue=1.04e-62; confidence=high
Rice	`Os05g0554100` - identity=57.3; qcov=0.869; evalue=7.43e-46; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00542 (Ribosomal_L12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771629.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057771629.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057771629.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771629.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1486841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B8
`Chr7:1486860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:1486929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:1486931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B74,C23
`Chr7:1487113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:1487122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C12,C55
`Chr7:1487127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,C11,C58,C69,C78
`Chr7:1487176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C30,C36,C6
`Chr7:1487209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C4,C53
`Chr7:1487218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:1487349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B88,B93
`Chr7:1487391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771629.1

213 aa

106

213

Ribosomal_L12

PF00542 Ribosomal_L12 146-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771629.1`	Pfam	`PF00542`	Ribosomal_L12	Domain	146	212	5.2e-23	81.9	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915646.1
AGATTCGATTCAAAATTATTCGATTCGTATTCAATAACAAATATTCGATTCGATTAGTATTTTAATATGTATTTCGATTCGACATTCGTTGATATTCGACTCGATATTTATATTTATATATATACTATTGATATATAATATTAATATTTTAATTATAATTTTTATGGAGTAATATCTAACTTCTAATTTTAGCCATCCTTTCAAAAAAAAAAAATTGTAGTTCTAACCCTAATTAGAATTAGGCGCGCCGCTCCCTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991426
ATGAGTTTGATTGTAAGAGCCAGGCATCGTTTGTGCAATGGAGCTTTTAGTAAACATATATACTCTCCCATCGTTGCATCTCGTTCTCCTAAGTCGATAACCAGACACTTTGCTCAAGCTGCAAAGTCTGAGAATGATGAGGAAGAAGAAGTAGAGATAGACCAGAGAAGGCTTCCAACTGATTACGACCCTTCAAATTTTGATCCGACAGAGCACCGTAGTCCTCCATCCGCAAGGGTTTGGAGGCTCGTTGATGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771629.1
MSLIVRARHRLCNGAFSKHIYSPIVASRSPKSITRHFAQAAKSENDEEEEVEIDQRRLPTDYDPSNFDPTEHRSPPSARVWRLVDEMAGLTLAEAAELSLIMRRMLSMKENVVVGVMKPGAGGVAGGATKAAAAAKEDKKPEKTAFELKMESFDAASKLKVIKEIRSFTDLGLKEAKELVEKAPSVLKKGVSKEEAEQIIEKMKAVGAKVVME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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