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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000230`

染色体: Chr07 坐标: 1492213-1495701 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000230`
名称	SmilChr07G000230
描述	protein XRI1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1492213 - 1495701 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991427`
GeneID	`130991427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991427`
原始查询	`LOC130991427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein XRI1-like
产物	protein XRI1-like
Arabidopsis	`AT5G48720` (XRI1) x-ray induced transcript 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834930] identity=44.6; qcov=1.06; evalue=1.57e-71; confidence=medium
Rice	`Os01g0918100` - identity=35; qcov=1.05; evalue=1.77e-38; confidence=low
GO	GO:0007140 (male meiotic nuclear division); GO:0007143 (female meiotic nuclear division)
KEGG	-
Pfam	PF27749 (XRI1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771630.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771630.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771630.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771630.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1492640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,C12,C15,C21,C42
`Chr7:1493680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:1493764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B44,C52
`Chr7:1494184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:1494638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C30,C36,C6
`Chr7:1494650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B72
`Chr7:1494786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C35,C45
`Chr7:1494819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C8
`Chr7:1494935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr7:1495358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B75,B9,C31
`Chr7:1495443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:1495461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B82,C9,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771630.1

289 aa

144

289

XRI1_C

PF27749 XRI1_C 257-289 aa

XP_057771631.1

288 aa

144

288

XRI1_C

PF27749 XRI1_C 256-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771630.1`	Pfam	`PF27749`	XRI1_C	Domain	257	289	1.6e-17	63.6	XRI1 C-terminal domain
`XP_057771631.1`	Pfam	`PF27749`	XRI1_C	Domain	256	288	1.6e-17	63.6	XRI1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915647.1
AATCCGAATATTTAGCATTGTGTAGAAATCATAAATCTTTTATTACCCGCGAATTAAGAATTAAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAACTGAGCCCAGTTTCAACCCACTACATCACTCGCTGCTGTCAGTTTTCAAGAGCTGATTTTTTTCCTTTTATTTTTTAATTTTTTTTTGTGCCTTCGAAATTGGCGAATTTCCATTAACATTTCCTTCCCTTTTCACGCCTGAACTGAAAGTTACAGTAGATGGGTTCTC...

XM_057915648.1
AATCCGAATATTTAGCATTGTGTAGAAATCATAAATCTTTTATTACCCGCGAATTAAGAATTAAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAACTGAGCCCAGTTTCAACCCACTACATCACTCGCTGCTGTCAGTTTTCAAGAGCTGATTTTTTTCCTTTTATTTTTTAATTTTTTTTTGTGCCTTCGAAATTGGCGAATTTCCATTAACATTTCCTTCCCTTTTCACGCCTGAACTGAAAGTTACAGTAGATGGGTTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991427
ATGGACTACAATTGCAATGAGATGTGGGATTGGCAAGGTGATGATTGCAGTCTTGAAGATAATACGAGCATAGAAATACTGACCGGTTTGAGCCAAAACGAAGAGCAGCTCCCTTGTTCTTTTGATGATGAAACTACACCGGTCAAGGCTTGTGGAGATTTAGCTCACCATGTAACCAACAACGAAGTTACGGGGAAAGAGTTAGAAGAAAATAGGGAGCATCCCTATCAAGTAAAAAGGCGTAGGATGCTACAGTTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771630.1
MDYNCNEMWDWQGDDCSLEDNTSIEILTGLSQNEEQLPCSFDDETTPVKACGDLAHHVTNNEVTGKELEENREHPYQVKRRRMLQFESEVLDSPPFHEEMFLRSKETQDSLEDAITDMSEWVNGFAGPAEPSSVYLEEGWIAECFNDDEMHFNAEDTSSAPEASDVQVDNGEDSNTAPEYDANAIEKHPVHSPGNVVFKGRKSYMRTPPKLASSVVYPFTFIKPCGVHGDVTLKDINKRIHTPPKSKQNEQDPSVPYPTS...

XP_057771631.1
MDYNCNEMWDWQGDDCSLEDNTSIEILTGLSQNEEQLPCSFDDETTPVKACGDLAHHVTNNEVTGKELEENREHPYQVKRRRMLQFESEVLDSPPFHEEMFLRSKETQDSLEDAITDMSEWVNGFAGPAEPSSVYLEEGWIAECFNDDEMHFNAEDTSAPEASDVQVDNGEDSNTAPEYDANAIEKHPVHSPGNVVFKGRKSYMRTPPKLASSVVYPFTFIKPCGVHGDVTLKDINKRIHTPPKSKQNEQDPSVPYPTSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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