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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000239`

染色体: Chr07 坐标: 1538299-1541489 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000239`
名称	SmilChr07G000239
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1538299 - 1541489 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991430`
GeneID	`130991430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991430`
原始查询	`LOC130991430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.7; qcov=1.03; evalue=2.23e-72; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.9; qcov=0.987; evalue=1.15e-79; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771639.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057771639.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771639.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771639.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1538778`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B127,B133,B37,B40,B45,B47,B55,B60,C18,C20,C23,C53,C86,D1
`Chr7:1538805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B41,C29,C3,C77
`Chr7:1538850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,C6,C84,C9
`Chr7:1538855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C48,D10
`Chr7:1538895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C68,D10
`Chr7:1538922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:1538928`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B120,B128,B139,B62,B85,C25,C38,C45,C71,C75,C8
`Chr7:1538936`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B85
`Chr7:1538936`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B85
`Chr7:1538993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B67,C43
`Chr7:1539002`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A10,B105,B109,B120,B122,B128,B131,B133,B139,B55,B56,B59,B8,B87,B90,B96,C20,C34,C38,C77,C8,C82
`Chr7:1539018`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771639.1

861 aa

430

861

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 149-315 aa PF23559 WHD_DRP 398-470 aa PF23598 LRR_14 528-830 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771639.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	149	315	1.1e-41	143.1	NB-ARC domain
`XP_057771639.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	398	470	1.1e-20	74.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057771639.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	528	830	1.2e-13	51.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915656.1
ATAGCCAACTATTACAATTTTGTTTATTTGCTCAAAGTCAATACAACAGTCAACATCTGCGTAGCGATATAGATTGGATGATTGTTGTGATATCTTCAAATTTGCTTATCCTTTGTGAGTGAGAAGAGATCAGAAAAATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCACGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCACAACTCGAATCCCTCCTCCAAAAAGCTGCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991430
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCACGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCACAACTCGAATCCCTCCTCCAAAAAGCTGCTTCTCTGCAGCAGATTCTTGAAAAATCTTCACCCTCCAAAATCATAGAGAATTTGGAAAGTCAAATCCAAGAAGCAGCACATAGAGCTGAAGATATCATTGAACCTCAGATGGTTGCTCAAATGCTTTCCAGCCCTGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771639.1
MAYNLQPLITILQQILNPEQSRWIVDHNKPQLESLLQKAASLQQILEKSSPSKIIENLESQIQEAAHRAEDIIEPQMVAQMLSSPEGVSFTFSTPDLQQEIQQLDSVMEQVVKLVEGKTMPSGSSLSGASLLPDPSSKSVVVGVDEALFQLKDRLTGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARTLYQDPLILDHFSYLAWTTISQDYNMLSILLSLLRCITGSDYKHKGDGELKDILYKSLYGRRYMIVLDDIWSTKFWDEIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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